69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1826 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  100 
 
 		 672 aa  1358    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  48.44 
 
 		 674 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  47.77 
 
 		 657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  47.77 
 
 		 657 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  48.53 
 
 		 681 aa  600  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  44.8 
 
 		 662 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  41.4 
 
 		 712 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  42.22 
 
 		 657 aa  467  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  38.94 
 
 		 659 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  42.73 
 
 		 668 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  42.92 
 
 		 655 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  40.36 
 
 		 663 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  37.91 
 
 		 663 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  39.34 
 
 		 659 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  36.17 
 
 		 661 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  38.39 
 
 		 678 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  36.71 
 
 		 660 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  36.79 
 
 		 659 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  37.13 
 
 		 661 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  37.94 
 
 		 678 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  39.91 
 
 		 675 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  38.69 
 
 		 686 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  33.04 
 
 		 672 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.4 
 
 		 659 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  40.03 
 
 		 693 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  33.43 
 
 		 672 aa  359  9e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  39.73 
 
 		 693 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  39.33 
 
 		 692 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  37.96 
 
 		 641 aa  351  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  34.48 
 
 		 652 aa  350  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  36.57 
 
 		 687 aa  348  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.06 
 
 		 662 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  37.21 
 
 		 610 aa  344  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  36.41 
 
 		 660 aa  343  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  30.36 
 
 		 651 aa  319  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  34.02 
 
 		 720 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  31.52 
 
 		 611 aa  283  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  30.87 
 
 		 614 aa  263  6.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  27.6 
 
 		 658 aa  243  7.999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.89 
 
 		 651 aa  231  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  39.52 
 
 		 565 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.04 
 
 		 656 aa  192  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.61 
 
 		 1433 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  23.53 
 
 		 1537 aa  91.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  25.74 
 
 		 1526 aa  91.3  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  22.89 
 
 		 1593 aa  73.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.83 
 
 		 721 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.61 
 
 		 725 aa  56.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.22 
 
 		 868 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.53 
 
 		 740 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.46 
 
 		 741 aa  50.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.51 
 
 		 740 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.99 
 
 		 740 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.99 
 
 		 740 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.58 
 
 		 740 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  27.91 
 
 		 758 aa  48.5  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  27.91 
 
 		 675 aa  47.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.91 
 
 		 770 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.91 
 
 		 776 aa  47.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.91 
 
 		 797 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.91 
 
 		 776 aa  47.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  27.91 
 
 		 770 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.45 
 
 		 741 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.8 
 
 		 740 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.38 
 
 		 734 aa  45.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.02 
 
 		 741 aa  45.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  26.44 
 
 		 757 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.55 
 
 		 734 aa  44.3  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.98 
 
 		 757 aa  43.9  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>