68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2703 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 657 aa  1368    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  52.25 
 
 		 712 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  55.99 
 
 		 681 aa  786    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  99.85 
 
 		 657 aa  1365    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  58.52 
 
 		 674 aa  818    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  57.92 
 
 		 662 aa  759    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  47.63 
 
 		 672 aa  611  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  47.51 
 
 		 657 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  42.84 
 
 		 659 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  42.9 
 
 		 661 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  42.92 
 
 		 655 aa  501  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  42.22 
 
 		 663 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  43.89 
 
 		 668 aa  502  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  42.99 
 
 		 661 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  41.2 
 
 		 663 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  39.4 
 
 		 675 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  39.51 
 
 		 678 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  37.61 
 
 		 659 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  39.51 
 
 		 660 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  39.78 
 
 		 652 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  39.39 
 
 		 678 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  38.23 
 
 		 686 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  38.28 
 
 		 659 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  38.02 
 
 		 687 aa  422  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  37.99 
 
 		 672 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  38.15 
 
 		 672 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  38.38 
 
 		 693 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  38 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  38.39 
 
 		 693 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  38.32 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.11 
 
 		 659 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  35.23 
 
 		 641 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.25 
 
 		 662 aa  346  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  34.66 
 
 		 660 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  34.22 
 
 		 720 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  44.16 
 
 		 651 aa  335  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  31.96 
 
 		 614 aa  296  6e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  30.39 
 
 		 611 aa  277  5e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.33 
 
 		 656 aa  263  8e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  28.72 
 
 		 658 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.24 
 
 		 651 aa  253  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.4 
 
 		 565 aa  217  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.74 
 
 		 1433 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  25.32 
 
 		 1593 aa  101  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  24.1 
 
 		 1526 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  25.25 
 
 		 1537 aa  87  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.38 
 
 		 725 aa  75.1  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.09 
 
 		 720 aa  67.4  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.95 
 
 		 741 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.13 
 
 		 723 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.47 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.62 
 
 		 760 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  24.94 
 
 		 758 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.96 
 
 		 734 aa  53.9  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.43 
 
 		 721 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.08 
 
 		 746 aa  51.2  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.7 
 
 		 698 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.85 
 
 		 734 aa  48.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.56 
 
 		 718 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.78 
 
 		 722 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.45 
 
 		 735 aa  45.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.89 
 
 		 708 aa  45.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 698 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  22.8 
 
 		 727 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.77 
 
 		 734 aa  44.3  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  23.81 
 
 		 729 aa  44.3  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.11 
 
 		 724 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  29.33 
 
 		 826 aa  43.9  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>