55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ03090 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  44.78 
 
 		 1537 aa  1291    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  100 
 
 		 1593 aa  3299    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  41.64 
 
 		 1526 aa  1201    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  26.25 
 
 		 661 aa  127  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  25.6 
 
 		 672 aa  115  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  24.62 
 
 		 662 aa  112  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  24.35 
 
 		 712 aa  112  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  23.77 
 
 		 651 aa  111  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  25.49 
 
 		 674 aa  111  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  25.38 
 
 		 655 aa  108  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  25.16 
 
 		 672 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  23.3 
 
 		 659 aa  107  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  25.32 
 
 		 657 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  25.32 
 
 		 657 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  24.35 
 
 		 681 aa  101  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  24.73 
 
 		 660 aa  100  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  26.22 
 
 		 686 aa  99.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  22.86 
 
 		 663 aa  96.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  25.11 
 
 		 663 aa  96.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.87 
 
 		 662 aa  96.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  25.93 
 
 		 660 aa  95.5  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  25.59 
 
 		 668 aa  95.9  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  21.68 
 
 		 661 aa  95.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  22.99 
 
 		 720 aa  89  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  25.57 
 
 		 687 aa  86.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  24.79 
 
 		 641 aa  85.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  23.45 
 
 		 659 aa  84.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  22.2 
 
 		 675 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  21.88 
 
 		 659 aa  79.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  23.78 
 
 		 652 aa  77  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  22.35 
 
 		 678 aa  76.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  22.89 
 
 		 672 aa  73.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  22.12 
 
 		 678 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.81 
 
 		 659 aa  70.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  34.58 
 
 		 420 aa  68.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  22.27 
 
 		 657 aa  67.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.44 
 
 		 1433 aa  67  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  21.38 
 
 		 611 aa  63.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  22.22 
 
 		 614 aa  57.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  23.67 
 
 		 610 aa  54.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  28.21 
 
 		 433 aa  53.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  21.09 
 
 		 692 aa  52.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  26.24 
 
 		 1124 aa  51.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  20.22 
 
 		 693 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  28.44 
 
 		 1122 aa  49.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  27.19 
 
 		 1124 aa  50.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  27.64 
 
 		 1124 aa  49.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  26.61 
 
 		 1126 aa  48.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  19.73 
 
 		 693 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 1122 aa  48.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 652 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  29.53 
 
 		 671 aa  47.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  26.99 
 
 		 660 aa  45.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 402 aa  45.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  30.46 
 
 		 1130 aa  45.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>