More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1954 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 433 aa  906    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  48.38 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  38.03 
 
 		 420 aa  316  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  35.96 
 
 		 402 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  32.51 
 
 		 1126 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  32.13 
 
 		 1122 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  31.61 
 
 		 1122 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  34.36 
 
 		 1124 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  32.29 
 
 		 1124 aa  227  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  31.84 
 
 		 1124 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 		 1151 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  24.27 
 
 		 1146 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  23.98 
 
 		 1144 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  23.57 
 
 		 1130 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  23.57 
 
 		 1130 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  23.8 
 
 		 1130 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  24.63 
 
 		 1201 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  24.26 
 
 		 1136 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  24.04 
 
 		 1133 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  23.18 
 
 		 1196 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  23.18 
 
 		 1196 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  22.81 
 
 		 1130 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  22.27 
 
 		 1131 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  24.22 
 
 		 646 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.32 
 
 		 1433 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  27.75 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 651 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 652 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 		 660 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 		 660 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  23.67 
 
 		 667 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  23.13 
 
 		 670 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  23.12 
 
 		 1136 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  25.43 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  22.49 
 
 		 1038 aa  93.2  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4658  alpha amylase catalytic region  24.47 
 
 		 681 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  21.99 
 
 		 687 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  25.86 
 
 		 688 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  24.54 
 
 		 651 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  22.17 
 
 		 1115 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  22.17 
 
 		 1115 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  24.43 
 
 		 684 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  23.9 
 
 		 1082 aa  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  21.34 
 
 		 716 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.99 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  25.15 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  22.28 
 
 		 663 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  24.07 
 
 		 1022 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  22.43 
 
 		 1115 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  22.58 
 
 		 674 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  22.6 
 
 		 671 aa  87.8  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  23.16 
 
 		 663 aa  87  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  24.63 
 
 		 460 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  26.23 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  26.41 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  22.57 
 
 		 1148 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  22.43 
 
 		 1115 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  22.69 
 
 		 657 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  22.5 
 
 		 659 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 1074 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  22.11 
 
 		 655 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2379  alpha amylase catalytic region  23.41 
 
 		 671 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0239  alpha amylase catalytic region  22.17 
 
 		 706 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00519899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  24.01 
 
 		 1075 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  21.46 
 
 		 734 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  22.47 
 
 		 672 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  23.81 
 
 		 816 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  23.29 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  21.76 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  22.49 
 
 		 684 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  23.12 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  21.46 
 
 		 715 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  28.72 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2537  alpha amylase, catalytic region  23.28 
 
 		 692 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2023  alpha amylase, catalytic region  22.41 
 
 		 707 aa  80.1  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  23.04 
 
 		 671 aa  79.7  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  21.59 
 
 		 672 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  23.15 
 
 		 676 aa  79  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  21.13 
 
 		 680 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  21.45 
 
 		 690 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  22.74 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  22.71 
 
 		 664 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  24.6 
 
 		 659 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 		 565 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  26.21 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  20.81 
 
 		 678 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  21.45 
 
 		 1037 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  21.01 
 
 		 696 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  24.63 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  20.74 
 
 		 684 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  23.66 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  21.76 
 
 		 695 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  20.55 
 
 		 724 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  21.76 
 
 		 695 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>