More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5097 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  57.47 
 
 		 661 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  47.77 
 
 		 1201 aa  976    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 1074 aa  2174    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  56.88 
 
 		 672 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  42.18 
 
 		 1124 aa  814    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  88.09 
 
 		 1075 aa  1927    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  57.12 
 
 		 672 aa  775    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  46.22 
 
 		 1140 aa  823    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  44.03 
 
 		 1148 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  57.08 
 
 		 664 aa  794    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  41.99 
 
 		 1124 aa  808    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  53.17 
 
 		 734 aa  707    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  44.12 
 
 		 1130 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  43.77 
 
 		 1122 aa  822    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  48.9 
 
 		 1196 aa  996    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  43.17 
 
 		 1122 aa  805    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  54.78 
 
 		 708 aa  743    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  46.35 
 
 		 1146 aa  917    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  44.82 
 
 		 1131 aa  830    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  56.48 
 
 		 672 aa  754    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  48.15 
 
 		 1144 aa  959    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  44.66 
 
 		 1130 aa  824    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  46.07 
 
 		 1022 aa  811    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  43.85 
 
 		 1115 aa  803    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  51.4 
 
 		 646 aa  651    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  63.13 
 
 		 1082 aa  1372    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  55.34 
 
 		 671 aa  740    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  57.78 
 
 		 660 aa  758    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  56.94 
 
 		 672 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  44.58 
 
 		 1115 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  48.9 
 
 		 1196 aa  996    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  43.77 
 
 		 1136 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  56.7 
 
 		 664 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  46.04 
 
 		 1151 aa  915    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  56.44 
 
 		 664 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  44.58 
 
 		 1115 aa  814    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  58.54 
 
 		 667 aa  766    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  43.71 
 
 		 1133 aa  813    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  44.82 
 
 		 1038 aa  806    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  46.52 
 
 		 1037 aa  888    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  57.78 
 
 		 672 aa  761    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  44.75 
 
 		 1130 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  42.13 
 
 		 1126 aa  783    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  41.93 
 
 		 1124 aa  810    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  53.27 
 
 		 724 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  53.01 
 
 		 715 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  43.58 
 
 		 1136 aa  812    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  43.85 
 
 		 1115 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  44.38 
 
 		 1130 aa  828    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  48.45 
 
 		 660 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  48.14 
 
 		 660 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  49.69 
 
 		 652 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  48.44 
 
 		 688 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  50.23 
 
 		 684 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  46.84 
 
 		 671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  50.7 
 
 		 651 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  49.77 
 
 		 651 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  45.39 
 
 		 670 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  47.69 
 
 		 676 aa  590  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0239  alpha amylase catalytic region  45 
 
 		 706 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00519899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  46.27 
 
 		 672 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  49.45 
 
 		 659 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4658  alpha amylase catalytic region  44.96 
 
 		 681 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  46.39 
 
 		 663 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  46.91 
 
 		 684 aa  582  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  51.37 
 
 		 657 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  46.95 
 
 		 679 aa  582  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2379  alpha amylase catalytic region  45.13 
 
 		 671 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  48.39 
 
 		 657 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2537  alpha amylase, catalytic region  45.9 
 
 		 692 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  44.29 
 
 		 652 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  46.04 
 
 		 705 aa  569  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  44.88 
 
 		 662 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  47.73 
 
 		 674 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2161  alpha amylase  44.99 
 
 		 680 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  43.96 
 
 		 672 aa  534  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2023  alpha amylase, catalytic region  44.01 
 
 		 707 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  43.41 
 
 		 672 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  44.09 
 
 		 653 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  44.13 
 
 		 655 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  41.99 
 
 		 816 aa  482  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  43.42 
 
 		 656 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  41.9 
 
 		 663 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  41 
 
 		 667 aa  477  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  42.29 
 
 		 716 aa  479  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  42.62 
 
 		 672 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  41.96 
 
 		 690 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  42.22 
 
 		 678 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  41.33 
 
 		 687 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1727  alpha amylase catalytic region  42.32 
 
 		 705 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  40.71 
 
 		 680 aa  462  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  41.52 
 
 		 681 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  42.15 
 
 		 684 aa  459  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 682 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03840  hypothetical protein  41.47 
 
 		 699 aa  458  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  39.38 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  39.38 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  39.38 
 
 		 695 aa  446  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  39.3 
 
 		 696 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19040  glycosidase  40.81 
 
 		 675 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000683856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>