More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0239 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0239  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 706 aa  1474    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00519899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4658  alpha amylase catalytic region  48.1 
 
 		 681 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  52.37 
 
 		 660 aa  715    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  52.91 
 
 		 662 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  66.17 
 
 		 672 aa  919    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  50.23 
 
 		 1122 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  65.92 
 
 		 671 aa  966    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  51.38 
 
 		 652 aa  706    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2161  alpha amylase  48.95 
 
 		 680 aa  648    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  53.4 
 
 		 679 aa  729    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  51.16 
 
 		 646 aa  641    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  48.77 
 
 		 671 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  66.07 
 
 		 670 aa  948    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  69.78 
 
 		 676 aa  1001    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2379  alpha amylase catalytic region  67.21 
 
 		 671 aa  958    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  52.4 
 
 		 674 aa  669    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  51.69 
 
 		 663 aa  688    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  50.07 
 
 		 705 aa  681    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2537  alpha amylase, catalytic region  66.42 
 
 		 692 aa  970    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  50.38 
 
 		 672 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2023  alpha amylase, catalytic region  49.93 
 
 		 707 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  50.3 
 
 		 684 aa  692    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  51.76 
 
 		 660 aa  719    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  48.18 
 
 		 652 aa  625  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  49.62 
 
 		 1126 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  48.93 
 
 		 1124 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  48.93 
 
 		 1124 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  49.62 
 
 		 1122 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  49.46 
 
 		 1124 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  47 
 
 		 734 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  45.54 
 
 		 1022 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  47.16 
 
 		 715 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  46.77 
 
 		 724 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  45.44 
 
 		 1082 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  46.37 
 
 		 1075 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  45 
 
 		 1074 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  47.09 
 
 		 659 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  47.09 
 
 		 651 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  46.07 
 
 		 684 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  45.69 
 
 		 688 aa  569  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  44.91 
 
 		 672 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  44.43 
 
 		 1196 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  45.76 
 
 		 651 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  45.54 
 
 		 1037 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  44.43 
 
 		 1196 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  44.21 
 
 		 1151 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  44.21 
 
 		 1144 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  44.51 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  45.13 
 
 		 657 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  44.76 
 
 		 1201 aa  558  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  44.14 
 
 		 672 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  44.14 
 
 		 660 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  45.38 
 
 		 657 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  42.6 
 
 		 708 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  44.05 
 
 		 1146 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  44.44 
 
 		 667 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  43.28 
 
 		 672 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  44.29 
 
 		 664 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  44.44 
 
 		 664 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  43.93 
 
 		 1140 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  44.67 
 
 		 672 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  42.79 
 
 		 672 aa  526  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  43.1 
 
 		 1038 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  42.73 
 
 		 1133 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  42.86 
 
 		 1136 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  43.05 
 
 		 1131 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  42.97 
 
 		 661 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  43.12 
 
 		 653 aa  524  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  43.67 
 
 		 656 aa  525  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  42.81 
 
 		 672 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  44.78 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  43.16 
 
 		 672 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  41.95 
 
 		 1130 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  42.34 
 
 		 1130 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  42.34 
 
 		 1130 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  42.19 
 
 		 1130 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  42.07 
 
 		 1148 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  42.07 
 
 		 1115 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  42.07 
 
 		 1136 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  42.07 
 
 		 1115 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  42.07 
 
 		 1115 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  42.07 
 
 		 1115 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  42.82 
 
 		 681 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  43.81 
 
 		 684 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  41.54 
 
 		 690 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  40.78 
 
 		 695 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  40.78 
 
 		 695 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  41.18 
 
 		 680 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  40.78 
 
 		 695 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  40.43 
 
 		 696 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  40.9 
 
 		 666 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  39.71 
 
 		 696 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  40.12 
 
 		 687 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  39.7 
 
 		 667 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1727  alpha amylase catalytic region  40.48 
 
 		 705 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  41.02 
 
 		 816 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  41.03 
 
 		 663 aa  465  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  41.43 
 
 		 666 aa  465  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  39.91 
 
 		 701 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 		 659 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>