More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4227 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  56.07 
 
 
661 aa  732    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  42.09 
 
 
1124 aa  776    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  51.45 
 
 
1201 aa  972    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  46.54 
 
 
1037 aa  847    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  57.72 
 
 
672 aa  781    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  57.12 
 
 
1022 aa  754    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  56.8 
 
 
664 aa  726    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  56.22 
 
 
672 aa  736    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  57.72 
 
 
672 aa  784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
1140 aa  2288    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  47.82 
 
 
1148 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 
1196 aa  973    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  58.58 
 
 
664 aa  780    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  49.01 
 
 
734 aa  707    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  45.64 
 
 
1130 aa  776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 
1196 aa  973    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 
1124 aa  772    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  42.14 
 
 
1124 aa  786    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  43.39 
 
 
1122 aa  775    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  44.6 
 
 
1075 aa  845    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  54.15 
 
 
708 aa  732    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  46.5 
 
 
1146 aa  890    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  45.93 
 
 
1130 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  55.74 
 
 
672 aa  733    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  58.15 
 
 
667 aa  762    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 
1131 aa  806    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  47.92 
 
 
1144 aa  916    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  54.99 
 
 
671 aa  732    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  57.68 
 
 
660 aa  756    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  45.68 
 
 
1136 aa  818    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  56.91 
 
 
664 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  47.12 
 
 
1038 aa  835    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  46.12 
 
 
1130 aa  807    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  46.02 
 
 
1130 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  42.97 
 
 
1122 aa  784    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  41.81 
 
 
1126 aa  762    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  56.35 
 
 
672 aa  711    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  47.99 
 
 
1136 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  47.87 
 
 
1115 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  52.91 
 
 
715 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  45.77 
 
 
1133 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  45.81 
 
 
1082 aa  862    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  48.25 
 
 
1115 aa  845    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  48.08 
 
 
1115 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  46.22 
 
 
1074 aa  848    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  47.78 
 
 
1115 aa  835    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  46.93 
 
 
1151 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  52.87 
 
 
724 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  48.57 
 
 
646 aa  628  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  48.62 
 
 
684 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  50.38 
 
 
651 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  47.04 
 
 
652 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  48.14 
 
 
688 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  49.69 
 
 
651 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  46.99 
 
 
679 aa  601  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  47.96 
 
 
657 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  45.64 
 
 
662 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  48.14 
 
 
659 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  45.62 
 
 
660 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  46.36 
 
 
705 aa  570  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  45.9 
 
 
676 aa  567  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2537  alpha amylase, catalytic region  45.41 
 
 
692 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  47.57 
 
 
657 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  45.65 
 
 
671 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  45.61 
 
 
660 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  45.79 
 
 
663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4658  alpha amylase catalytic region  43.84 
 
 
681 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  42.99 
 
 
670 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  48.78 
 
 
674 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  47.47 
 
 
684 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0239  alpha amylase catalytic region  43.93 
 
 
706 aa  547  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00519899  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  44.59 
 
 
672 aa  542  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2379  alpha amylase catalytic region  44.16 
 
 
671 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  42.9 
 
 
652 aa  533  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  45.27 
 
 
681 aa  526  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2161  alpha amylase  44.89 
 
 
680 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  44.86 
 
 
656 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2023  alpha amylase, catalytic region  45.8 
 
 
707 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.685343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  44.02 
 
 
672 aa  516  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  45.1 
 
 
672 aa  511  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  43.64 
 
 
655 aa  503  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  44.41 
 
 
653 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  45.63 
 
 
684 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  43.25 
 
 
716 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  43.52 
 
 
672 aa  493  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  42.03 
 
 
690 aa  489  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  41.77 
 
 
687 aa  483  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  43.82 
 
 
816 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1727  alpha amylase catalytic region  40.76 
 
 
705 aa  480  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  42.68 
 
 
663 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  41.81 
 
 
680 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  41.22 
 
 
695 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  41.22 
 
 
695 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  41.22 
 
 
695 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  42.39 
 
 
678 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03840  hypothetical protein  43.65 
 
 
699 aa  466  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  42.58 
 
 
667 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1809  alpha amylase, catalytic region  42.04 
 
 
670 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  39.91 
 
 
696 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  40.17 
 
 
696 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>