More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3934 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  63.92 
 
 
666 aa  885    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  52.75 
 
 
655 aa  668    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  63.41 
 
 
666 aa  875    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  57.25 
 
 
672 aa  760    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  50.72 
 
 
667 aa  648    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  55.52 
 
 
672 aa  734    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
695 aa  1414    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  57.6 
 
 
684 aa  724    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  50.14 
 
 
690 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  54.04 
 
 
653 aa  685    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1809  alpha amylase, catalytic region  51.64 
 
 
670 aa  661    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  76.88 
 
 
701 aa  1076    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
695 aa  1414    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  62.35 
 
 
659 aa  821    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  87.03 
 
 
696 aa  1246    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  57.08 
 
 
687 aa  754    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  55.26 
 
 
681 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  53.47 
 
 
656 aa  666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  99.71 
 
 
695 aa  1411    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  85.73 
 
 
696 aa  1228    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03840  hypothetical protein  51.76 
 
 
699 aa  634  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  48.86 
 
 
680 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  49.57 
 
 
663 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  49.36 
 
 
716 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  48.31 
 
 
816 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1727  alpha amylase catalytic region  47.63 
 
 
705 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8140  alpha amylase catalytic region  58.5 
 
 
728 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  49.78 
 
 
678 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  45.6 
 
 
682 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  45.01 
 
 
652 aa  570  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19040  glycosidase  47.19 
 
 
675 aa  568  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000683856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  45.84 
 
 
715 aa  550  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  44.07 
 
 
662 aa  532  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  44.1 
 
 
705 aa  525  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  43.53 
 
 
684 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  45.97 
 
 
674 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  44.32 
 
 
672 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2161  alpha amylase  43.68 
 
 
680 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  43.61 
 
 
679 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  41.03 
 
 
657 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  41.45 
 
 
676 aa  503  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  41.1 
 
 
671 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  43 
 
 
688 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  41.97 
 
 
672 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  41.78 
 
 
651 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  44.35 
 
 
663 aa  497  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2023  alpha amylase, catalytic region  43.58 
 
 
707 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.685343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  42.19 
 
 
657 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0239  alpha amylase catalytic region  40.78 
 
 
706 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00519899  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  41.52 
 
 
684 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  41.62 
 
 
651 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  42.2 
 
 
660 aa  492  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  39.8 
 
 
652 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4658  alpha amylase catalytic region  41.22 
 
 
681 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  41.07 
 
 
670 aa  488  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  42.25 
 
 
1037 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  41.24 
 
 
672 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2379  alpha amylase catalytic region  41.36 
 
 
671 aa  488  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  41.4 
 
 
660 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  40.96 
 
 
660 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  43.13 
 
 
659 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  43.11 
 
 
646 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2537  alpha amylase, catalytic region  41.16 
 
 
692 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  40.27 
 
 
1124 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1190  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.29 
 
 
746 aa  479  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  40.29 
 
 
1124 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  40.29 
 
 
1124 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  40.09 
 
 
1126 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  42.05 
 
 
672 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  41.28 
 
 
1144 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  40.15 
 
 
671 aa  468  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  42.11 
 
 
664 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  41.59 
 
 
672 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  42.41 
 
 
664 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  39.6 
 
 
708 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  40.8 
 
 
1022 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  43.19 
 
 
1131 aa  465  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  40.94 
 
 
1146 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  42.48 
 
 
1133 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  40.2 
 
 
1151 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  41.36 
 
 
672 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  41.07 
 
 
724 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  40.39 
 
 
1082 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  41.22 
 
 
1140 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  40.83 
 
 
734 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  39.41 
 
 
1196 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  39.41 
 
 
1196 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  40.48 
 
 
715 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  40.92 
 
 
661 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  39.61 
 
 
1201 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  40.62 
 
 
672 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  41.58 
 
 
1130 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  40.71 
 
 
664 aa  452  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  38.74 
 
 
1122 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  41.74 
 
 
667 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  41.43 
 
 
1130 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  41.87 
 
 
1136 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  41.58 
 
 
1130 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  41.57 
 
 
1148 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  39.97 
 
 
1075 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>