248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3800 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 435 aa  890    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  48.38 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  36.61 
 
 		 402 aa  316  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  34.66 
 
 		 420 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  37 
 
 		 1126 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  36.47 
 
 		 476 aa  266  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  36.49 
 
 		 1122 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  35.65 
 
 		 1122 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  36.52 
 
 		 1124 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  34.15 
 
 		 1124 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  33.91 
 
 		 1124 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  21.95 
 
 		 1151 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 1144 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  21.71 
 
 		 1146 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  22.33 
 
 		 1196 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  22.33 
 
 		 1196 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  22.49 
 
 		 1201 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.6 
 
 		 1433 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  26.42 
 
 		 646 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  20.05 
 
 		 1082 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  27.89 
 
 		 426 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  24.15 
 
 		 1074 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  21.74 
 
 		 1133 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  29.21 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 652 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  21.04 
 
 		 1136 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  25.99 
 
 		 1075 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  21.74 
 
 		 1130 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  21.74 
 
 		 1130 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  25.4 
 
 		 816 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  21.52 
 
 		 1130 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4658  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 681 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  28.52 
 
 		 663 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  27.3 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 670 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 651 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  20.35 
 
 		 1131 aa  86.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  29.59 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  24.38 
 
 		 672 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  23.85 
 
 		 724 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  31.48 
 
 		 688 aa  84  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  23.98 
 
 		 672 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  24.55 
 
 		 1037 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2379  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 		 671 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  22.75 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  22.71 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  24.81 
 
 		 734 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  18.64 
 
 		 1130 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  24.47 
 
 		 716 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  21.84 
 
 		 687 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  25.32 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  24.16 
 
 		 715 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 659 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  22.25 
 
 		 674 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0239  alpha amylase catalytic region  24.09 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00519899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2448  hypothetical protein  23.57 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  23.19 
 
 		 672 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  22.39 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2593  hypothetical protein  23.45 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 		 684 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  25.29 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  24.02 
 
 		 664 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  23.19 
 
 		 656 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  23 
 
 		 708 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  24.27 
 
 		 672 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  23.33 
 
 		 660 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  23.56 
 
 		 667 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  26.51 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  22.7 
 
 		 1038 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  23.17 
 
 		 682 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  23.91 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  23.04 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  25.08 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2023  alpha amylase, catalytic region  21.66 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  25.95 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  22.83 
 
 		 1022 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  25.71 
 
 		 690 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  21.34 
 
 		 667 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2537  alpha amylase, catalytic region  26.21 
 
 		 692 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1727  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 		 705 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  25.38 
 
 		 657 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  25.6 
 
 		 672 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 		 680 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  23.79 
 
 		 1140 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  35.88 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  26.51 
 
 		 657 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  24.11 
 
 		 664 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  24.84 
 
 		 696 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  25.66 
 
 		 701 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  23.87 
 
 		 664 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  22 
 
 		 671 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  29.41 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  22.76 
 
 		 655 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  22.89 
 
 		 672 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  23.7 
 
 		 652 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  26.7 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>