55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2448 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2593  hypothetical protein  95.35 
 
 		 516 aa  1040    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2448  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1087    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  25.67 
 
 		 1122 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  25.56 
 
 		 1122 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  24.13 
 
 		 1124 aa  108  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  24.34 
 
 		 1124 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 		 1126 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 		 1124 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1643  hypothetical protein  25.9 
 
 		 705 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1636  hypothetical protein  25.9 
 
 		 705 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1634  hypothetical protein  23.29 
 
 		 701 aa  94.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  25.07 
 
 		 420 aa  91.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1641  hypothetical protein  23.53 
 
 		 700 aa  90.1  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  23.44 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  23.57 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  20.21 
 
 		 1146 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  19.85 
 
 		 1151 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  21.97 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  23.15 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  23.73 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  24.03 
 
 		 1201 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  21.65 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  25.62 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  22.18 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  19.84 
 
 		 1144 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  22.31 
 
 		 1196 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  22.31 
 
 		 1196 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  21.98 
 
 		 459 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  24.83 
 
 		 1131 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  23.08 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  22.34 
 
 		 752 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  28.08 
 
 		 1075 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 1074 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.12 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  21.69 
 
 		 1130 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  20.49 
 
 		 1133 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  24.64 
 
 		 1088 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  20.2 
 
 		 925 aa  44.3  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  24.86 
 
 		 1148 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  24.86 
 
 		 1136 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  24.86 
 
 		 1115 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  24.86 
 
 		 1115 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  24.86 
 
 		 1115 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  24.86 
 
 		 1115 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  23.22 
 
 		 1088 aa  43.9  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  23.22 
 
 		 1088 aa  43.9  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  27.37 
 
 		 786 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  20.22 
 
 		 1136 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  27.37 
 
 		 774 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  27.37 
 
 		 765 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  23.35 
 
 		 505 aa  43.5  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  27.37 
 
 		 778 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  23.36 
 
 		 507 aa  43.5  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>