More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19040  glycosidase  52.29 
 
 
675 aa  675    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000683856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  53.52 
 
 
655 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03840  hypothetical protein  53.19 
 
 
699 aa  686    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  54.58 
 
 
816 aa  732    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  56.57 
 
 
678 aa  709    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  61.67 
 
 
682 aa  846    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  57.59 
 
 
667 aa  754    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  53.48 
 
 
672 aa  685    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  54.39 
 
 
684 aa  702    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1727  alpha amylase catalytic region  53.68 
 
 
705 aa  726    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8140  alpha amylase catalytic region  50.34 
 
 
728 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  58.83 
 
 
663 aa  793    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  54.07 
 
 
681 aa  701    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0737  alpha amylase, catalytic region  53.38 
 
 
690 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.456985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  51.48 
 
 
672 aa  673    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  50.86 
 
 
653 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0861  alpha amylase catalytic region  51.55 
 
 
680 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1809  alpha amylase, catalytic region  51.2 
 
 
670 aa  660    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  100 
 
 
715 aa  1436    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  56.78 
 
 
716 aa  752    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  53.95 
 
 
656 aa  698    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  49.44 
 
 
687 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  48.51 
 
 
659 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1190  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.5 
 
 
746 aa  566  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  46.46 
 
 
695 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  46.46 
 
 
695 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  45.63 
 
 
695 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  47.61 
 
 
666 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  45.92 
 
 
696 aa  555  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  44.8 
 
 
696 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  45.03 
 
 
701 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  45.3 
 
 
666 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  41.05 
 
 
652 aa  511  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4097  alpha amylase catalytic sub domain protein  42.14 
 
 
672 aa  492  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0571346  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  42.02 
 
 
679 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  44.82 
 
 
674 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  40.67 
 
 
646 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  40.54 
 
 
662 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  41.24 
 
 
688 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  40.67 
 
 
663 aa  458  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  39.97 
 
 
705 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  40.64 
 
 
657 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2379  alpha amylase catalytic region  38.73 
 
 
671 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  40.81 
 
 
657 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  38.41 
 
 
670 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1979  alpha amylase catalytic region  40.23 
 
 
684 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  39.25 
 
 
1122 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  39.74 
 
 
708 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  39.83 
 
 
660 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 
1122 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  39.44 
 
 
660 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  38.96 
 
 
672 aa  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  38.78 
 
 
1124 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  38.64 
 
 
1022 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  39.11 
 
 
1124 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  38.78 
 
 
1124 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  39.14 
 
 
672 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  40.68 
 
 
684 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  41.06 
 
 
651 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  40.62 
 
 
667 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  38.64 
 
 
671 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  38.65 
 
 
660 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  38.64 
 
 
734 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0239  alpha amylase catalytic region  37.04 
 
 
706 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00519899  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  37.38 
 
 
671 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  40.38 
 
 
651 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  38.98 
 
 
1082 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  39.35 
 
 
724 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  39.12 
 
 
715 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0210  alpha amylase catalytic region  37.69 
 
 
676 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  40.73 
 
 
1140 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2161  alpha amylase  40.06 
 
 
680 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  40.62 
 
 
659 aa  436  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4658  alpha amylase catalytic region  37.29 
 
 
681 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  36.98 
 
 
652 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  39.26 
 
 
664 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  38.44 
 
 
664 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  37.96 
 
 
1074 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  39.29 
 
 
664 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  39.31 
 
 
1196 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  38.68 
 
 
1037 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  39.31 
 
 
1196 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  38.37 
 
 
1075 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  37.98 
 
 
1126 aa  425  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2023  alpha amylase, catalytic region  40.66 
 
 
707 aa  426  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.685343 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  39.8 
 
 
1201 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  38.4 
 
 
672 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  38.8 
 
 
672 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2537  alpha amylase, catalytic region  37.03 
 
 
692 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  38.25 
 
 
661 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  37.23 
 
 
1144 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  37.94 
 
 
672 aa  405  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  38.37 
 
 
1146 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  37.74 
 
 
1151 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  39.04 
 
 
1038 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1815  alpha amylase catalytic region  38.63 
 
 
672 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474679  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  39.16 
 
 
1133 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  40.49 
 
 
1115 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  40.49 
 
 
1136 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  40.49 
 
 
1115 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>