54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2593 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2593  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1086    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2448  hypothetical protein  95.35 
 
 		 516 aa  1040    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  24.31 
 
 		 1122 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  24.37 
 
 		 1122 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  23.7 
 
 		 1124 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 		 1124 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 		 1126 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  24.28 
 
 		 1124 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1643  hypothetical protein  25.77 
 
 		 705 aa  97.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1634  hypothetical protein  23.53 
 
 		 701 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1636  hypothetical protein  25.77 
 
 		 705 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1641  hypothetical protein  23.7 
 
 		 700 aa  93.6  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  25.07 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  23.3 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  23.46 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  23.45 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  20.47 
 
 		 1146 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  28.72 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  21.77 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  21.01 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  19.59 
 
 		 1151 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  23.18 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  23.76 
 
 		 1201 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  25.62 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  21.99 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  20.1 
 
 		 1144 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  21.84 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  22.52 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  24.65 
 
 		 1131 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  21.78 
 
 		 1196 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  21.78 
 
 		 1196 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  22.84 
 
 		 752 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 459 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 		 1130 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  25.43 
 
 		 1148 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  22.53 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  21.45 
 
 		 1074 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  27.67 
 
 		 1075 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  20.77 
 
 		 1133 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  25.43 
 
 		 1115 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  25.43 
 
 		 1115 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  25.43 
 
 		 1115 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  25.43 
 
 		 1136 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  25.43 
 
 		 1115 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  28.42 
 
 		 786 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  23.7 
 
 		 1088 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  23.7 
 
 		 1088 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  28.42 
 
 		 774 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  20.49 
 
 		 1136 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  28.42 
 
 		 765 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  24.64 
 
 		 1088 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  28.42 
 
 		 778 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  20 
 
 		 925 aa  43.9  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  24.15 
 
 		 534 aa  43.5  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>