158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0916 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 476 aa  973    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  34.29 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  36.47 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  36.46 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  39.04 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  35.69 
 
 		 1122 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  33.43 
 
 		 1122 aa  203  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  33.14 
 
 		 1126 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  32.86 
 
 		 1124 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  32.01 
 
 		 1124 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  31.15 
 
 		 1124 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  24.52 
 
 		 1146 aa  126  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  22.73 
 
 		 1144 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  23.98 
 
 		 1151 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  20.79 
 
 		 1196 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  22.56 
 
 		 1133 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  20.79 
 
 		 1196 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  22.16 
 
 		 1136 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  22.82 
 
 		 1201 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  22.42 
 
 		 1130 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.12 
 
 		 1433 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  22.42 
 
 		 1130 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  22.16 
 
 		 1130 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  23.61 
 
 		 1082 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  21.79 
 
 		 1130 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  20.21 
 
 		 1131 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  24.44 
 
 		 426 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2593  hypothetical protein  22.75 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2448  hypothetical protein  22.5 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  27.59 
 
 		 1148 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  27.59 
 
 		 1136 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  27.59 
 
 		 1115 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  27.59 
 
 		 1115 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  27.59 
 
 		 1115 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  28.42 
 
 		 1115 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  22.97 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.81 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  22.59 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  19.35 
 
 		 1074 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  19.06 
 
 		 1075 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 		 579 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  22.74 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  30.93 
 
 		 1038 aa  63.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1636  hypothetical protein  25.3 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 		 467 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1643  hypothetical protein  24.9 
 
 		 705 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  24.05 
 
 		 716 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  18.82 
 
 		 1140 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  22.81 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  23.79 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  20.31 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  22.81 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  21 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  21 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  23.73 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  22.65 
 
 		 659 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  21.8 
 
 		 588 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  21.81 
 
 		 652 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  20.69 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  24.25 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  23.42 
 
 		 589 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 		 586 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  21.98 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1634  hypothetical protein  22.31 
 
 		 701 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  28.72 
 
 		 1022 aa  53.9  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  21.49 
 
 		 663 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  22.96 
 
 		 551 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  20.99 
 
 		 681 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1641  hypothetical protein  22.81 
 
 		 700 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  22.73 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  23.74 
 
 		 581 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  26.63 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  24.1 
 
 		 620 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  23.32 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  26 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  23.44 
 
 		 651 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  31.18 
 
 		 692 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 1037 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  23.53 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  23.69 
 
 		 534 aa  50.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  21.67 
 
 		 701 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 574 aa  50.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  22.04 
 
 		 543 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  23.69 
 
 		 1048 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  22.67 
 
 		 816 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  20.95 
 
 		 626 aa  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  26.21 
 
 		 653 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  22.89 
 
 		 672 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  21.25 
 
 		 684 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0161  alpha amylase, catalytic region  25.17 
 
 		 637 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00960046  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  20.36 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0159  hypothetical protein  25.17 
 
 		 637 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00185609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  20.49 
 
 		 657 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  19.61 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  23.03 
 
 		 758 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62666  alpha-glucosidase maltase  26.96 
 
 		 572 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.97685  normal  0.170022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  20.56 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  24.76 
 
 		 546 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>