More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2758 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  60.35 
 
 		 565 aa  709    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 579 aa  1201    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  48.91 
 
 		 610 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  52.31 
 
 		 534 aa  533  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  48.97 
 
 		 650 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  44.95 
 
 		 709 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  45.51 
 
 		 676 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  49.26 
 
 		 581 aa  496  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  44.79 
 
 		 704 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  44.39 
 
 		 709 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  43.6 
 
 		 673 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  47.82 
 
 		 624 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  42.68 
 
 		 761 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  47.61 
 
 		 667 aa  485  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  42.6 
 
 		 766 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  42.53 
 
 		 736 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  42.81 
 
 		 715 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  45.86 
 
 		 630 aa  478  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  43.44 
 
 		 653 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  43.66 
 
 		 668 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  47.82 
 
 		 626 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  37.18 
 
 		 574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  29.76 
 
 		 426 aa  96.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 493 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 493 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  24.38 
 
 		 493 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  22.72 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  22.22 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 		 481 aa  76.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  22.55 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  25.34 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  26.01 
 
 		 728 aa  73.6  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  24.24 
 
 		 513 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  22.2 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  38.2 
 
 		 708 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  23.93 
 
 		 532 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  22.22 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.72 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  24.63 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 758 aa  67  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  32.76 
 
 		 426 aa  67  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  23.8 
 
 		 538 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  28.13 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  24.69 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  23.51 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  23.51 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  45.76 
 
 		 672 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  29.92 
 
 		 671 aa  65.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  22.26 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  42.37 
 
 		 672 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  23.68 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  21.86 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  22.31 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  22.95 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  22.46 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  24.63 
 
 		 1005 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  24 
 
 		 1942 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  27.35 
 
 		 724 aa  63.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  31.01 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  25.4 
 
 		 535 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  28.12 
 
 		 1151 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.21 
 
 		 1433 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  22.26 
 
 		 540 aa  62  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  24.39 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  32.38 
 
 		 1126 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  27.34 
 
 		 1146 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  40.68 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  24.26 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  21.11 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  30.32 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  29.7 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  34.38 
 
 		 734 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  25.78 
 
 		 1131 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  34.38 
 
 		 715 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  23.94 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  22.69 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  28.5 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  21.41 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  23.99 
 
 		 1124 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  26.59 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  22.67 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  23.33 
 
 		 575 aa  60.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  40.68 
 
 		 664 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 484 aa  60.1  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  23.91 
 
 		 667 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  20.87 
 
 		 555 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  24.54 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  23.57 
 
 		 1017 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 1133 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  21.21 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  22.12 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  28.87 
 
 		 1136 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  23.86 
 
 		 620 aa  59.7  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>