32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1643 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1643  hypothetical protein  100 
 
 		 705 aa  1471    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1636  hypothetical protein  96.44 
 
 		 705 aa  1419    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1634  hypothetical protein  42.73 
 
 		 701 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1641  hypothetical protein  42.97 
 
 		 700 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2593  hypothetical protein  25.77 
 
 		 516 aa  97.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2448  hypothetical protein  25.9 
 
 		 516 aa  95.5  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  25.96 
 
 		 433 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  29.03 
 
 		 1122 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  28.72 
 
 		 402 aa  63.9  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  24.68 
 
 		 420 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  25.23 
 
 		 1126 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 1122 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  23.79 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 435 aa  56.6  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  24.86 
 
 		 422 aa  55.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  25.56 
 
 		 422 aa  53.9  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 1124 aa  52  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 1124 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  23.73 
 
 		 463 aa  50.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  22.45 
 
 		 426 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  23.56 
 
 		 478 aa  48.5  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  22.6 
 
 		 434 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.7 
 
 		 467 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 459 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  25.46 
 
 		 1124 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  21.93 
 
 		 679 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  30.56 
 
 		 1196 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  30.56 
 
 		 1196 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  24.11 
 
 		 1021 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  23.41 
 
 		 705 aa  45.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  30.56 
 
 		 1201 aa  45.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  28.16 
 
 		 450 aa  44.3  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>