266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1637 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 574 aa  1192    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 565 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  37.18 
 
 		 579 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  38.79 
 
 		 534 aa  318  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  33.83 
 
 		 581 aa  273  9e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 650 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  34.36 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  31.28 
 
 		 673 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  33.94 
 
 		 667 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  30.9 
 
 		 653 aa  259  9e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  31.03 
 
 		 709 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  30.1 
 
 		 709 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  30.49 
 
 		 704 aa  253  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  35.11 
 
 		 715 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  33.81 
 
 		 668 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  34.04 
 
 		 761 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  30.5 
 
 		 736 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  34.16 
 
 		 766 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  30.84 
 
 		 630 aa  246  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  30.69 
 
 		 624 aa  246  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  35.2 
 
 		 626 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  31.84 
 
 		 676 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  22.24 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  23.33 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  24.7 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  23.14 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  22.99 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  21.18 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  27.14 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  21.41 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  23.61 
 
 		 480 aa  67  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  22.89 
 
 		 575 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0107  alpha-amylase family protein  23.41 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  22.42 
 
 		 588 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  23.57 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.13 
 
 		 1891 aa  64.3  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  27.91 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  27.71 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  25.1 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  23.29 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  23.77 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  29.14 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  21.1 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  27.33 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  21.11 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  23.45 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  24.44 
 
 		 481 aa  57  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.05 
 
 		 511 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  22.62 
 
 		 480 aa  57  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  30.3 
 
 		 1082 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 708 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  23.14 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.7 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  22.85 
 
 		 482 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  27.53 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 1131 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  25.95 
 
 		 1075 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  37.93 
 
 		 724 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  20.43 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  23.66 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  38.6 
 
 		 1151 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  23.48 
 
 		 1101 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  27.47 
 
 		 688 aa  54.7  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  27.33 
 
 		 433 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  27.33 
 
 		 433 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  38.89 
 
 		 651 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  38.6 
 
 		 1146 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  30.21 
 
 		 1074 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  36.84 
 
 		 1201 aa  54.3  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  31.91 
 
 		 1144 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  23.52 
 
 		 600 aa  54.3  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 		 1122 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 660 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  38.89 
 
 		 651 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 1196 aa  53.9  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 1196 aa  53.9  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  38.89 
 
 		 1140 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  39.66 
 
 		 1038 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  30.1 
 
 		 1148 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  37.93 
 
 		 672 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  23 
 
 		 1144 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  30.1 
 
 		 1136 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  30.1 
 
 		 1115 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  30.1 
 
 		 1115 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  30.1 
 
 		 1115 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  30.1 
 
 		 1115 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  36.21 
 
 		 734 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  26.58 
 
 		 1130 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1176  alpha-amylase family protein  25.97 
 
 		 634 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.470418  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  26.94 
 
 		 1133 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  28.72 
 
 		 1122 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>