97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1684 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
481 aa  1007    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  64.17 
 
 
482 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  58.68 
 
 
493 aa  610  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  58.54 
 
 
480 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  56.46 
 
 
505 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  57.83 
 
 
481 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  56.49 
 
 
480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  39.41 
 
 
492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  38.15 
 
 
484 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  35.93 
 
 
493 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  35.93 
 
 
493 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  35.88 
 
 
485 aa  290  4e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  39.7 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  41.22 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  36.86 
 
 
513 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  28.26 
 
 
1101 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  28 
 
 
1229 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 
1214 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  26.26 
 
 
1153 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  27.75 
 
 
1231 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  26.64 
 
 
1202 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  27.96 
 
 
1118 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  25.68 
 
 
1201 aa  141  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  27.53 
 
 
1193 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  27.96 
 
 
1118 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  28.97 
 
 
1181 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  25.51 
 
 
1253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  26.45 
 
 
1164 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  26.15 
 
 
1128 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  25.21 
 
 
1177 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  24.38 
 
 
1167 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  26 
 
 
1173 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  24.74 
 
 
1144 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 
1186 aa  127  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  25.89 
 
 
1172 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  23.65 
 
 
1165 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  25.11 
 
 
478 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  23.25 
 
 
434 aa  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  25.82 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  28.05 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  26.63 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  26.63 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  24.09 
 
 
565 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 
579 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  27.37 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  24.93 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  22.34 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  27.21 
 
 
463 aa  70.1  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 
574 aa  68.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  23.49 
 
 
459 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  21.85 
 
 
499 aa  59.3  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  24.5 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  20.36 
 
 
515 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  25.22 
 
 
630 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  22.12 
 
 
650 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  20.63 
 
 
728 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  24.28 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  23.11 
 
 
676 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  24 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  24 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  25 
 
 
534 aa  51.2  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  21.84 
 
 
610 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  24.88 
 
 
420 aa  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  24.64 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  20.78 
 
 
481 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 
511 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  23.57 
 
 
541 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  22.48 
 
 
687 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  23.82 
 
 
668 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
758 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 
479 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  22.39 
 
 
463 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  22.08 
 
 
450 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  24.9 
 
 
1048 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 
593 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  22.88 
 
 
588 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  22.39 
 
 
402 aa  46.6  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  23.57 
 
 
541 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  23.08 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  22.8 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  26.06 
 
 
646 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  24.42 
 
 
545 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  33.7 
 
 
736 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  33.7 
 
 
766 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  25.57 
 
 
581 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 
761 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 
715 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  22.73 
 
 
709 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  22.76 
 
 
614 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  44.44 
 
 
934 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  35.14 
 
 
1411 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  22.5 
 
 
667 aa  44.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  21.77 
 
 
510 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.03 
 
 
1647 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  24.86 
 
 
472 aa  43.5  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  36.17 
 
 
673 aa  43.5  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>