More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2212 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  84.09 
 
 		 673 aa  1191    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  53.94 
 
 		 581 aa  654    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  60.38 
 
 		 668 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  56.7 
 
 		 630 aa  696    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  58.06 
 
 		 624 aa  748    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  60.12 
 
 		 653 aa  756    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  59.37 
 
 		 650 aa  775    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  94.92 
 
 		 704 aa  1401    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 709 aa  1477    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  64.07 
 
 		 676 aa  822    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  69.94 
 
 		 736 aa  1019    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  92.81 
 
 		 709 aa  1377    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  74.77 
 
 		 761 aa  1005    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  74.35 
 
 		 766 aa  1012    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  56.13 
 
 		 610 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  70.56 
 
 		 715 aa  1019    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  58.31 
 
 		 667 aa  796    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  53.21 
 
 		 626 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  44.95 
 
 		 579 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  42.32 
 
 		 565 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  36.81 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  30.71 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  24.63 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  37.88 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 		 493 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 		 493 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  23.7 
 
 		 654 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  30.72 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  30.72 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  29.59 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  23.56 
 
 		 522 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  26.28 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  29.44 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  30.72 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  26.56 
 
 		 663 aa  61.2  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  50 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  23.73 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  27.88 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  29.45 
 
 		 532 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  21.89 
 
 		 550 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  27.81 
 
 		 538 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.7 
 
 		 1855 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  32.32 
 
 		 713 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  38.33 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  29.91 
 
 		 1131 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0159  hypothetical protein  23.66 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00185609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  32.58 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  22.12 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  24.1 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  21.59 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0161  alpha amylase, catalytic region  23.66 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00960046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  29.31 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  29.71 
 
 		 1130 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  27.59 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  28.36 
 
 		 1130 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  28.36 
 
 		 1130 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  36.84 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  21.16 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  28.04 
 
 		 1115 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  29.63 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  26.97 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  26.43 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  28.04 
 
 		 1136 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  28.04 
 
 		 1115 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  28.04 
 
 		 1115 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  28.04 
 
 		 1115 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  28.04 
 
 		 1148 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  36.84 
 
 		 713 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  21.36 
 
 		 441 aa  57  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  27.87 
 
 		 1126 aa  57  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  29.81 
 
 		 459 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  37.1 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  29.73 
 
 		 667 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 1124 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 1124 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  35.96 
 
 		 713 aa  55.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  29.47 
 
 		 1130 aa  55.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  35.96 
 
 		 713 aa  55.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 		 622 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  26.43 
 
 		 558 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  35.96 
 
 		 713 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  36.84 
 
 		 713 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  34.04 
 
 		 426 aa  55.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 1037 aa  55.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  25.6 
 
 		 644 aa  55.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  40.35 
 
 		 483 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  28.83 
 
 		 660 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  38.78 
 
 		 713 aa  55.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  36.84 
 
 		 713 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  28.04 
 
 		 734 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 		 1133 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  29.01 
 
 		 522 aa  55.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.32 
 
 		 2068 aa  55.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 1074 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 1075 aa  55.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 1124 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  28.04 
 
 		 715 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>