122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0673 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  65.97 
 
 		 480 aa  670    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 505 aa  1059    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  70.42 
 
 		 493 aa  733    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  66.04 
 
 		 480 aa  686    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  60.62 
 
 		 481 aa  630  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  56.46 
 
 		 481 aa  589  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  56.25 
 
 		 482 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  38.98 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  38.02 
 
 		 492 aa  320  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  41.96 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  42.64 
 
 		 497 aa  294  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  38.61 
 
 		 493 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  35.35 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  35.35 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  36.3 
 
 		 513 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 1172 aa  144  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 		 1214 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 		 1153 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  25.25 
 
 		 1193 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  26.98 
 
 		 1173 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 1118 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 1118 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  26.59 
 
 		 1231 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  25.99 
 
 		 1144 aa  136  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  24.71 
 
 		 1186 aa  136  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  23.8 
 
 		 1181 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  26.34 
 
 		 1229 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  25.58 
 
 		 1101 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  24.69 
 
 		 1202 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  26.03 
 
 		 1128 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  25.4 
 
 		 1253 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  23.82 
 
 		 1167 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  24.25 
 
 		 1164 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  25.17 
 
 		 1201 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  25.61 
 
 		 1177 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  23.06 
 
 		 1165 aa  127  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  24.27 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  24.5 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  28.06 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  25.28 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  26.54 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  25.08 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  25.13 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  23.33 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  24.57 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  22.17 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  21.89 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  25.39 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  25.69 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  24.39 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  21.5 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  24.16 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  24.78 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 687 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 		 758 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  24.85 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  23.31 
 
 		 539 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  23.74 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  24.81 
 
 		 537 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  24.16 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  20.6 
 
 		 450 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  22.02 
 
 		 536 aa  54.3  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  21.69 
 
 		 630 aa  53.5  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  28.96 
 
 		 646 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  29.45 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  25.83 
 
 		 529 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.93 
 
 		 541 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  24.13 
 
 		 545 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  21.69 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  25.86 
 
 		 549 aa  50.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  24.65 
 
 		 534 aa  50.8  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  22.67 
 
 		 1048 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  22.83 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  21.95 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1967  alpha amylase, catalytic region  23.95 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000720647  hitchhiker  0.000000000127887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24.25 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1294  alpha amylase, catalytic domain protein  20.94 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  22.38 
 
 		 654 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  29.33 
 
 		 652 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  24.33 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  22.8 
 
 		 528 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  23.12 
 
 		 682 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2149  alpha amylase, catalytic region  22.96 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  25.37 
 
 		 708 aa  47.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  22.99 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  22.37 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  23.24 
 
 		 553 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  25.47 
 
 		 1201 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  25.18 
 
 		 402 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  27.95 
 
 		 645 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  20.17 
 
 		 667 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  22.37 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 1151 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  27.09 
 
 		 643 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  22.37 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 		 672 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  21.35 
 
 		 624 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>