44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1485 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  48.8 
 
 		 1201 aa  913    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  53.34 
 
 		 1214 aa  1186    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  60.27 
 
 		 1253 aa  1117    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  54.82 
 
 		 1118 aa  895    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  54.45 
 
 		 1118 aa  890    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  47.11 
 
 		 1186 aa  832    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  51.1 
 
 		 1164 aa  851    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  51.37 
 
 		 1173 aa  845    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  51.53 
 
 		 1128 aa  861    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  48.75 
 
 		 1172 aa  859    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  86.54 
 
 		 1231 aa  2194    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 1229 aa  2523    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  53.18 
 
 		 1153 aa  874    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  46.2 
 
 		 1193 aa  923    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  51.27 
 
 		 1101 aa  844    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  54.9 
 
 		 1177 aa  886    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  47.59 
 
 		 1165 aa  825    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  49.94 
 
 		 1144 aa  838    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  48.58 
 
 		 1167 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  55.53 
 
 		 1181 aa  905    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  48.74 
 
 		 1202 aa  1117    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  27.86 
 
 		 493 aa  159  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  27.71 
 
 		 485 aa  156  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 482 aa  151  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 		 480 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  28 
 
 		 481 aa  146  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 492 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  26.34 
 
 		 505 aa  134  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 		 493 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 		 493 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  25.06 
 
 		 481 aa  131  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  24.57 
 
 		 480 aa  129  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  24.6 
 
 		 513 aa  125  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  27.03 
 
 		 484 aa  125  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  25.8 
 
 		 493 aa  124  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  26.14 
 
 		 497 aa  98.2  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.39 
 
 		 459 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  33.01 
 
 		 467 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  27.21 
 
 		 547 aa  49.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  22.67 
 
 		 668 aa  48.9  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  24.41 
 
 		 574 aa  47.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  22.42 
 
 		 515 aa  45.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  26.14 
 
 		 665 aa  45.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  30.88 
 
 		 426 aa  45.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>