45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1778 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  55.97 
 
 
1186 aa  1311    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  45.42 
 
 
1193 aa  763    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  56.75 
 
 
1172 aa  1306    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  49.61 
 
 
1231 aa  835    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  42.63 
 
 
1229 aa  855    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  49.14 
 
 
1128 aa  740    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  46.34 
 
 
1153 aa  735    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  63.31 
 
 
1173 aa  1536    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
1164 aa  2414    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  55.74 
 
 
1167 aa  1293    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  46.86 
 
 
1177 aa  739    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  47.37 
 
 
1118 aa  770    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 
1118 aa  774    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  43.8 
 
 
1202 aa  829    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  50.73 
 
 
1181 aa  780    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  49.88 
 
 
1253 aa  795    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  53.94 
 
 
1144 aa  1226    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  56.02 
 
 
1165 aa  1297    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  50.11 
 
 
1214 aa  823    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  48.47 
 
 
1101 aa  757    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  44.14 
 
 
1201 aa  788    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  26.33 
 
 
485 aa  149  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 
482 aa  138  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  26.45 
 
 
481 aa  135  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 
480 aa  134  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  25.94 
 
 
493 aa  131  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  24.25 
 
 
505 aa  128  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 
493 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 
493 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  23.37 
 
 
481 aa  121  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 
484 aa  119  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  25.3 
 
 
492 aa  118  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  22.22 
 
 
480 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  24.13 
 
 
493 aa  112  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  21.99 
 
 
513 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  24.31 
 
 
497 aa  94.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  22.94 
 
 
459 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  31.07 
 
 
422 aa  51.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  28.43 
 
 
426 aa  50.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  32 
 
 
426 aa  49.7  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  28.16 
 
 
422 aa  49.3  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  21.18 
 
 
478 aa  48.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 
554 aa  46.6  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  39.13 
 
 
435 aa  46.2  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  29.9 
 
 
527 aa  45.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>