48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1982 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  52.89 
 
 		 1186 aa  1261    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  50.06 
 
 		 1231 aa  848    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  51.37 
 
 		 1229 aa  845    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  44.51 
 
 		 1193 aa  770    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  48.74 
 
 		 1153 aa  778    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  55.12 
 
 		 1172 aa  1286    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  49.68 
 
 		 1128 aa  735    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  53.48 
 
 		 1167 aa  1243    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  41.49 
 
 		 1177 aa  747    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 1173 aa  2430    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  62.95 
 
 		 1164 aa  1525    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  46.8 
 
 		 1118 aa  771    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  47.58 
 
 		 1202 aa  840    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  48.61 
 
 		 1181 aa  781    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  40.9 
 
 		 1118 aa  776    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  52.3 
 
 		 1144 aa  1196    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  53.6 
 
 		 1165 aa  1278    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  50.12 
 
 		 1253 aa  802    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  49.94 
 
 		 1101 aa  737    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  50.29 
 
 		 1214 aa  836    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  47.35 
 
 		 1201 aa  780    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 485 aa  154  7e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 		 480 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  27.05 
 
 		 505 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  25.37 
 
 		 482 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  23.22 
 
 		 493 aa  138  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  23.22 
 
 		 493 aa  138  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  25.66 
 
 		 484 aa  137  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  27.49 
 
 		 492 aa  132  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  24.81 
 
 		 480 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  26.2 
 
 		 493 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  26 
 
 		 481 aa  128  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  23.48 
 
 		 481 aa  128  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  23.88 
 
 		 493 aa  127  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  24.43 
 
 		 513 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  26.45 
 
 		 497 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  22.08 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 422 aa  57.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  30.3 
 
 		 422 aa  52.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  22.64 
 
 		 574 aa  52  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  31.37 
 
 		 1021 aa  50.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  33.33 
 
 		 426 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  34.44 
 
 		 467 aa  48.5  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 426 aa  48.5  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  29.9 
 
 		 450 aa  48.5  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  20.48 
 
 		 420 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  21.09 
 
 		 478 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  30.61 
 
 		 630 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>