276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0386 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 493 aa  1002    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  56.26 
 
 		 493 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  56.26 
 
 		 493 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  54.94 
 
 		 513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  44.9 
 
 		 492 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  43.79 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  42.55 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  34.7 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  42.25 
 
 		 482 aa  306  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  40.7 
 
 		 480 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  39.55 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  37.65 
 
 		 480 aa  296  8e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  36.06 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  38.61 
 
 		 505 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  39.7 
 
 		 481 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  28.71 
 
 		 1177 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  28.03 
 
 		 1181 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  24.91 
 
 		 1214 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  24.09 
 
 		 1165 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  25.41 
 
 		 1193 aa  133  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  25 
 
 		 1201 aa  130  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 		 1118 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  25.13 
 
 		 1202 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  25.92 
 
 		 1118 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  23.15 
 
 		 1167 aa  128  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  23.88 
 
 		 1173 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  23.85 
 
 		 1253 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  23.92 
 
 		 1153 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  25.8 
 
 		 1229 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  26.33 
 
 		 1101 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 1128 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 1172 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  26.03 
 
 		 1231 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  24 
 
 		 1144 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 1186 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  29.24 
 
 		 459 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  24.13 
 
 		 1164 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01070  hypothetical protein  56.57 
 
 		 109 aa  103  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  24.04 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  23.63 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  21.02 
 
 		 426 aa  86.7  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  24.84 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  21.4 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  22.39 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  22.14 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 579 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  25.45 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  23.36 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 		 758 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  24.68 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 		 565 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 687 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 574 aa  70.1  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.33 
 
 		 515 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1967  alpha amylase, catalytic region  27.44 
 
 		 536 aa  67.8  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000720647  hitchhiker  0.000000000127887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  28.08 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  28.62 
 
 		 583 aa  63.9  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.59 
 
 		 499 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 		 728 aa  63.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  25.9 
 
 		 1122 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.13 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  28.31 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  27.21 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  22.57 
 
 		 630 aa  62.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  27.89 
 
 		 402 aa  62  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  28.52 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  28.03 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.83 
 
 		 654 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  25.25 
 
 		 1124 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  26.38 
 
 		 1122 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  21.82 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  26.8 
 
 		 1126 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  30.95 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 		 1124 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  28.11 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  28.11 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  28.11 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 		 1124 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  28.3 
 
 		 518 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  24.06 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  31.13 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  21.92 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0222  alpha amylase, catalytic region  26.55 
 
 		 529 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0439399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  25.58 
 
 		 715 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  26.26 
 
 		 591 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  26.41 
 
 		 593 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  23.95 
 
 		 668 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  25.09 
 
 		 558 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  25.34 
 
 		 571 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  28.03 
 
 		 646 aa  53.9  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  24 
 
 		 258 aa  53.9  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  25.9 
 
 		 556 aa  53.5  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  32.09 
 
 		 674 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  30.87 
 
 		 641 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  28.24 
 
 		 561 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>