62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1492 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  48.74 
 
 		 1229 aa  1140    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  48.6 
 
 		 1214 aa  1085    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  54.02 
 
 		 1253 aa  1010    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  43.66 
 
 		 1118 aa  884    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  43.22 
 
 		 1118 aa  873    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  47.77 
 
 		 1186 aa  857    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  47.75 
 
 		 1164 aa  846    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  47.62 
 
 		 1173 aa  855    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  47.06 
 
 		 1128 aa  838    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  49.88 
 
 		 1172 aa  884    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  49.14 
 
 		 1231 aa  1150    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  42.76 
 
 		 1193 aa  855    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  43.08 
 
 		 1153 aa  851    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  41.24 
 
 		 1167 aa  849    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  51.57 
 
 		 1177 aa  839    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  47.66 
 
 		 1165 aa  878    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  45.45 
 
 		 1201 aa  857    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  100 
 
 		 1202 aa  2491    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  47.1 
 
 		 1144 aa  838    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  45.06 
 
 		 1181 aa  858    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  48.18 
 
 		 1101 aa  774    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  28.31 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 482 aa  157  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 493 aa  152  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  26.84 
 
 		 481 aa  141  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 493 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 493 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  26.37 
 
 		 480 aa  139  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  26.3 
 
 		 513 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  25.06 
 
 		 481 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  25.43 
 
 		 505 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  25.13 
 
 		 493 aa  128  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  25.31 
 
 		 480 aa  128  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 		 484 aa  126  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  26.1 
 
 		 492 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 		 497 aa  93.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  25.19 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5485  malto-oligosyltrehalose synthase  38.1 
 
 		 920 aa  57  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102779 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  34.31 
 
 		 924 aa  54.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  34.31 
 
 		 921 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  34.31 
 
 		 922 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  34.31 
 
 		 921 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  20.4 
 
 		 467 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  38.81 
 
 		 426 aa  52  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7028  maltooligosyl trehalose synthase  32.32 
 
 		 923 aa  51.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  29.7 
 
 		 426 aa  50.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  34.31 
 
 		 924 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  27.23 
 
 		 515 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  32.08 
 
 		 927 aa  47.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.37 
 
 		 1647 aa  46.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3144  maltooligosyl trehalose synthase  33.01 
 
 		 926 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  28.16 
 
 		 944 aa  46.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  31.13 
 
 		 927 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  34.52 
 
 		 952 aa  46.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36605  maltooligosyl trehalose synthase  33.01 
 
 		 926 aa  45.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1334  malto-oligosyltrehalose synthase  34.72 
 
 		 930 aa  45.8  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.929488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0540  malto-oligosyltrehalose synthase  34.72 
 
 		 930 aa  45.8  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0816  maltooligosyl trehalose synthase, putative  34.72 
 
 		 930 aa  45.8  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.133141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1539  alpha-amylase family protein  34.72 
 
 		 930 aa  45.8  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1562  malto-oligosyltrehalose synthase  34.72 
 
 		 930 aa  45.8  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.497391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1733  malto-oligosyltrehalose synthase  34.72 
 
 		 967 aa  45.8  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0615  malto-oligosyltrehalose synthase  34.72 
 
 		 930 aa  45.8  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>