46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3591 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  46.03 
 
 
1201 aa  780    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  44.6 
 
 
1214 aa  890    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  45.84 
 
 
1253 aa  861    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  56.88 
 
 
1118 aa  1212    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  56.6 
 
 
1118 aa  1200    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  47.33 
 
 
1186 aa  765    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  47.41 
 
 
1164 aa  743    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  48.74 
 
 
1173 aa  786    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  50.86 
 
 
1128 aa  1025    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  44.82 
 
 
1172 aa  769    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  45.34 
 
 
1231 aa  922    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  53.18 
 
 
1229 aa  889    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
1153 aa  2363    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  44.66 
 
 
1144 aa  787    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  56.36 
 
 
1193 aa  1178    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  46.32 
 
 
1101 aa  904    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  46.94 
 
 
1165 aa  790    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  50.46 
 
 
1167 aa  752    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  58.69 
 
 
1181 aa  1254    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  43.08 
 
 
1202 aa  848    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  51.79 
 
 
1177 aa  1088    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  28.31 
 
 
485 aa  167  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  26.37 
 
 
493 aa  145  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 
482 aa  144  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 
481 aa  144  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 
505 aa  142  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  26.79 
 
 
484 aa  142  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  23.46 
 
 
493 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  23.46 
 
 
493 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 
480 aa  137  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 
492 aa  135  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  24.1 
 
 
493 aa  125  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  24.88 
 
 
481 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  23.75 
 
 
480 aa  119  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  25.39 
 
 
513 aa  119  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  27.02 
 
 
497 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 
459 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  25.71 
 
 
558 aa  56.2  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  22.97 
 
 
467 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  22.8 
 
 
515 aa  52.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 
547 aa  49.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  27.84 
 
 
564 aa  48.5  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  23.13 
 
 
552 aa  47.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  23.51 
 
 
574 aa  47  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  22.34 
 
 
545 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  31.13 
 
 
575 aa  45.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>