47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0431 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  61.18 
 
 		 1172 aa  1457    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  40.91 
 
 		 1214 aa  808    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  47.07 
 
 		 1253 aa  791    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  44.67 
 
 		 1118 aa  764    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  45.94 
 
 		 1118 aa  756    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  63.6 
 
 		 1186 aa  1516    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  55.71 
 
 		 1164 aa  1283    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  53.48 
 
 		 1173 aa  1254    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  49.54 
 
 		 1128 aa  722    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  40.93 
 
 		 1193 aa  754    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  48.72 
 
 		 1231 aa  830    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  48.58 
 
 		 1229 aa  827    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  50.8 
 
 		 1153 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  61.37 
 
 		 1144 aa  1425    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  44.87 
 
 		 1201 aa  768    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  50.27 
 
 		 1101 aa  728    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  62.31 
 
 		 1165 aa  1502    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  49.76 
 
 		 1181 aa  776    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  41.32 
 
 		 1202 aa  841    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 1167 aa  2420    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  45.56 
 
 		 1177 aa  737    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  23.44 
 
 		 482 aa  145  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 485 aa  141  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 493 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 		 493 aa  136  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 		 493 aa  136  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  23.09 
 
 		 480 aa  135  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  23.08 
 
 		 480 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  23.82 
 
 		 505 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  23.15 
 
 		 493 aa  128  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  22.79 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  23.72 
 
 		 484 aa  119  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  23.41 
 
 		 513 aa  118  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  22.03 
 
 		 481 aa  115  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  24.04 
 
 		 497 aa  100  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  22.61 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  31.3 
 
 		 630 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  32.39 
 
 		 426 aa  50.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  29.09 
 
 		 426 aa  49.7  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  29.81 
 
 		 467 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  27.78 
 
 		 732 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  30.56 
 
 		 553 aa  45.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  30.56 
 
 		 553 aa  45.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 		 619 aa  45.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  29.29 
 
 		 422 aa  44.7  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  29.31 
 
 		 554 aa  44.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>