More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0138 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0393  alpha amylase catalytic region  71.49 
 
 		 735 aa  1057    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0232636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 732 aa  1474    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  34.94 
 
 		 752 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1076  alpha amylase domain-containing protein  32.26 
 
 		 685 aa  317  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.819574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  26.11 
 
 		 463 aa  99  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  24.82 
 
 		 434 aa  98.2  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  25.46 
 
 		 459 aa  94.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  23.04 
 
 		 422 aa  91.3  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  23.29 
 
 		 426 aa  88.2  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  22.28 
 
 		 422 aa  87.4  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  22.8 
 
 		 426 aa  77  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  24.5 
 
 		 1048 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  23.77 
 
 		 587 aa  76.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  23.43 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  21.81 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 1124 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 1124 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  22.67 
 
 		 563 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  24.3 
 
 		 687 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  29.83 
 
 		 1122 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  32.33 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  32.33 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  32.33 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  23.49 
 
 		 1124 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  25.97 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  21.21 
 
 		 563 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.84 
 
 		 1433 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  26.55 
 
 		 639 aa  66.6  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  20.46 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 1126 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  24.59 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  31.97 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  24.17 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  27.95 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  27.8 
 
 		 1093 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  23.92 
 
 		 551 aa  63.9  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  30.08 
 
 		 1100 aa  63.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  24.78 
 
 		 606 aa  63.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  24.44 
 
 		 672 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  29.24 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  27.66 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  22.79 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  24.25 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  25 
 
 		 1099 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  31.49 
 
 		 695 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  31.49 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  31.49 
 
 		 695 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  31.45 
 
 		 1061 aa  62  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  31.01 
 
 		 1100 aa  62  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  27.66 
 
 		 479 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  32.03 
 
 		 1110 aa  61.6  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  25.42 
 
 		 1100 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  27.33 
 
 		 1115 aa  61.6  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  23.75 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  24.8 
 
 		 663 aa  61.2  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  28.65 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  34.96 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  29.31 
 
 		 688 aa  60.8  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  31.15 
 
 		 1110 aa  60.8  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  25.23 
 
 		 511 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  23.18 
 
 		 568 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  27.6 
 
 		 1154 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 674 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  31.71 
 
 		 590 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  21.95 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  24.31 
 
 		 1122 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  25.54 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  21.69 
 
 		 562 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  25.24 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  25.36 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42120  alpha-glucosidase maltase  23.26 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217758  normal  0.25099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  26.92 
 
 		 1106 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  30.33 
 
 		 1088 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  30.33 
 
 		 1088 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1294  alpha amylase, catalytic domain protein  25.79 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  23.06 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  21.86 
 
 		 643 aa  58.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.82 
 
 		 1113 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  26.92 
 
 		 1106 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  22.28 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  25.58 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  22.49 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60352  alpha-glucosidase maltase  24.07 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  22.49 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  30.53 
 
 		 1100 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  25.93 
 
 		 1154 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  24.2 
 
 		 671 aa  58.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  22.38 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  26.92 
 
 		 1105 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  26.58 
 
 		 1093 aa  58.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  30.33 
 
 		 1139 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  26.9 
 
 		 1106 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>