148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2955 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  50.56 
 
 		 1193 aa  876    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  45.11 
 
 		 1201 aa  755    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  100 
 
 		 1101 aa  2236    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  51.08 
 
 		 1165 aa  749    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  48.66 
 
 		 1144 aa  746    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  48.44 
 
 		 1181 aa  939    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  48.18 
 
 		 1202 aa  761    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  47.46 
 
 		 1118 aa  899    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  43.57 
 
 		 1214 aa  847    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  47.52 
 
 		 1177 aa  879    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  50.27 
 
 		 1167 aa  734    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  46 
 
 		 1253 aa  817    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  46.06 
 
 		 1153 aa  909    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  51.15 
 
 		 1229 aa  852    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  51.21 
 
 		 1231 aa  852    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  48.17 
 
 		 1172 aa  743    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  45.22 
 
 		 1128 aa  836    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  43.46 
 
 		 1173 aa  742    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  48.47 
 
 		 1164 aa  763    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  48.26 
 
 		 1186 aa  731    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  46.92 
 
 		 1118 aa  886    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  26.5 
 
 		 492 aa  160  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  26.94 
 
 		 485 aa  157  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 481 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  27.32 
 
 		 482 aa  148  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  25.48 
 
 		 480 aa  147  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 493 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  22.91 
 
 		 493 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  22.91 
 
 		 493 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  23.45 
 
 		 481 aa  136  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  25.58 
 
 		 505 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 		 484 aa  134  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  23.72 
 
 		 513 aa  128  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  23.5 
 
 		 480 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  26.33 
 
 		 493 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 497 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  24.47 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  21.83 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  33.98 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  22.39 
 
 		 576 aa  57.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 574 aa  55.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  37.62 
 
 		 571 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  34.33 
 
 		 426 aa  53.5  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 544 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  23.25 
 
 		 566 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  22.1 
 
 		 543 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  31 
 
 		 426 aa  53.5  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  26.38 
 
 		 530 aa  53.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  27.31 
 
 		 551 aa  52.4  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  33.63 
 
 		 535 aa  52.4  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.82 
 
 		 531 aa  52  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 		 562 aa  52  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 		 557 aa  52  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  30.85 
 
 		 606 aa  51.6  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  24.49 
 
 		 552 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  31.68 
 
 		 563 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  23.34 
 
 		 545 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  23.69 
 
 		 657 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  31.03 
 
 		 665 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 580 aa  50.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  26.59 
 
 		 558 aa  50.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  33.33 
 
 		 620 aa  50.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  25.51 
 
 		 547 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  22.96 
 
 		 515 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  33 
 
 		 554 aa  49.7  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  29.35 
 
 		 564 aa  49.7  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 		 522 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  30.17 
 
 		 478 aa  49.7  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  28.04 
 
 		 686 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  36 
 
 		 605 aa  49.3  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  26.75 
 
 		 599 aa  49.3  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  33 
 
 		 536 aa  48.9  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  29.91 
 
 		 665 aa  48.9  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  35.87 
 
 		 582 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 510 aa  48.5  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.97 
 
 		 556 aa  48.9  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  23.34 
 
 		 541 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  26.59 
 
 		 518 aa  48.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  31.3 
 
 		 591 aa  48.1  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  32.11 
 
 		 554 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  36.67 
 
 		 607 aa  47.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  33.64 
 
 		 568 aa  47.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  22.68 
 
 		 549 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  22.68 
 
 		 549 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  25.24 
 
 		 553 aa  47.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  23.23 
 
 		 542 aa  47.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 529 aa  47.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  28.41 
 
 		 661 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 		 555 aa  47.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  23.5 
 
 		 565 aa  47.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  23.85 
 
 		 735 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  32.11 
 
 		 554 aa  47.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  32.97 
 
 		 640 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 654 aa  47  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  32 
 
 		 562 aa  47  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  23.05 
 
 		 541 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  29.91 
 
 		 554 aa  46.2  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  22.96 
 
 		 1136 aa  46.2  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  24.93 
 
 		 540 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  31.52 
 
 		 558 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>