262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2108 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 493 aa  1026    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 493 aa  1026    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  56.26 
 
 		 493 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  56.52 
 
 		 513 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  41.1 
 
 		 492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  41.05 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  36.27 
 
 		 480 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  40.5 
 
 		 482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  40.1 
 
 		 480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  34.84 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  38.02 
 
 		 493 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  36.99 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  35.87 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  35.93 
 
 		 481 aa  292  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  35.35 
 
 		 505 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 		 1214 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  24.56 
 
 		 1202 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  22.91 
 
 		 1101 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  23.46 
 
 		 1153 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  23.5 
 
 		 1193 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  23.22 
 
 		 1173 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  23.62 
 
 		 1177 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  23.67 
 
 		 1231 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  23.28 
 
 		 1167 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  23.28 
 
 		 1229 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  24.6 
 
 		 1165 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  23.2 
 
 		 1118 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  22.7 
 
 		 1128 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  23.02 
 
 		 1118 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  23.64 
 
 		 1186 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  23.51 
 
 		 1181 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  22.02 
 
 		 1144 aa  125  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 1164 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  25.47 
 
 		 1201 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  22.86 
 
 		 1253 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  23.8 
 
 		 1172 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  24.79 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  24.51 
 
 		 426 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01070  hypothetical protein  40.78 
 
 		 109 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  27.93 
 
 		 459 aa  94.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 579 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.77 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  24.26 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  24.93 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  21.7 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  29.79 
 
 		 534 aa  82.4  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  24.33 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  23.2 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  22.56 
 
 		 624 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 		 715 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 		 761 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  24.4 
 
 		 709 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  25.65 
 
 		 736 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  24.53 
 
 		 673 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  25.94 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  22.45 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 		 1126 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  24.34 
 
 		 709 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  25.09 
 
 		 758 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  24.75 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  24.05 
 
 		 704 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  27.4 
 
 		 1136 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  27.4 
 
 		 1133 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  22.77 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 		 668 aa  60.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 1122 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  20 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  23.51 
 
 		 1124 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  22.41 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  23.15 
 
 		 1124 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 		 459 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  31.29 
 
 		 641 aa  57  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  23.66 
 
 		 1122 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  22.85 
 
 		 1124 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 1131 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  24.75 
 
 		 1148 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  26.71 
 
 		 1130 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  26.71 
 
 		 1130 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  26.84 
 
 		 682 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  24.75 
 
 		 1115 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  24.75 
 
 		 1115 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  25.15 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  22.31 
 
 		 510 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60352  alpha-glucosidase maltase  24.55 
 
 		 572 aa  54.7  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  26.37 
 
 		 1130 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  20.64 
 
 		 499 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  24.72 
 
 		 659 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  24.79 
 
 		 630 aa  53.5  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  22.79 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  21.59 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  27.15 
 
 		 649 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  26.37 
 
 		 1130 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  23.64 
 
 		 676 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  24.41 
 
 		 1136 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  24.41 
 
 		 1115 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>