89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1416 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  60.17 
 
 		 480 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  1010    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  61.17 
 
 		 493 aa  629  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  60.62 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  59.5 
 
 		 480 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  57.83 
 
 		 481 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  56.16 
 
 		 482 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  36.99 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  36.06 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  36.99 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  39.59 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  36.93 
 
 		 492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  42.28 
 
 		 497 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  38.07 
 
 		 485 aa  277  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  35.86 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  23.45 
 
 		 1101 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  25.3 
 
 		 1201 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  25.06 
 
 		 1202 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  25.23 
 
 		 1214 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 		 1231 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  25.06 
 
 		 1229 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  25.24 
 
 		 1193 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 1173 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 		 1128 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  22.4 
 
 		 1186 aa  123  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  24.08 
 
 		 1253 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  23.36 
 
 		 1164 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  25.12 
 
 		 1181 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  24.88 
 
 		 1153 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  23.51 
 
 		 1144 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  24.75 
 
 		 1177 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  22.28 
 
 		 1165 aa  117  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  24.47 
 
 		 1118 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 1172 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  24.71 
 
 		 1118 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  22.03 
 
 		 1167 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  24.1 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  28.74 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  23.03 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  23.89 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  25.84 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  25.84 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  22.89 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  24.3 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  26.04 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  25.64 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.81 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  20.33 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  24.26 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  24 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1294  alpha amylase, catalytic domain protein  22.78 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  22.79 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  22.81 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  23.66 
 
 		 581 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  23.92 
 
 		 687 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.04 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 		 574 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  24.36 
 
 		 758 aa  53.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  25.32 
 
 		 433 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  24.38 
 
 		 524 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  23.91 
 
 		 479 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 		 528 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  22.11 
 
 		 614 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.44 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.44 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  24.04 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  24.02 
 
 		 687 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  21.99 
 
 		 709 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62666  alpha-glucosidase maltase  24.73 
 
 		 572 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.97685  normal  0.170022 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  20.37 
 
 		 499 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  28 
 
 		 645 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  23.2 
 
 		 448 aa  47  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  23.46 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  28.67 
 
 		 652 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 		 688 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  22.04 
 
 		 605 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  22.04 
 
 		 605 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  22.04 
 
 		 605 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24.3 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.74 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  24.55 
 
 		 626 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  24.69 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 		 666 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  23.67 
 
 		 545 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  21.45 
 
 		 673 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  23.92 
 
 		 666 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1190  trehalose-6-phosphate hydrolase  22.37 
 
 		 746 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  23.23 
 
 		 650 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  21.87 
 
 		 668 aa  43.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>