55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0263 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  49.68 
 
 		 1193 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  41.64 
 
 		 1214 aa  793    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  49 
 
 		 1253 aa  786    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  45.51 
 
 		 1118 aa  757    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  46.18 
 
 		 1118 aa  743    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  67.41 
 
 		 1186 aa  1602    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  54.21 
 
 		 1164 aa  1228    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  52.3 
 
 		 1173 aa  1207    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  49.8 
 
 		 1128 aa  725    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  60.69 
 
 		 1172 aa  1407    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  49.71 
 
 		 1231 aa  832    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  49.94 
 
 		 1229 aa  838    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  48.54 
 
 		 1153 aa  777    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  61.37 
 
 		 1167 aa  1440    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  41.33 
 
 		 1177 aa  767    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  45.68 
 
 		 1201 aa  780    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  48.54 
 
 		 1101 aa  740    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  62.4 
 
 		 1165 aa  1478    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  41.65 
 
 		 1202 aa  825    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 1144 aa  2377    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  49.27 
 
 		 1181 aa  759    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  26.19 
 
 		 485 aa  152  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  27.65 
 
 		 493 aa  140  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 		 505 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  26.05 
 
 		 482 aa  135  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 480 aa  134  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 		 481 aa  128  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  22.02 
 
 		 493 aa  125  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  22.02 
 
 		 493 aa  125  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  23.92 
 
 		 513 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  23.51 
 
 		 481 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  24 
 
 		 493 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  22.97 
 
 		 492 aa  116  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 		 484 aa  114  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  23.57 
 
 		 480 aa  112  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  24.83 
 
 		 497 aa  89  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 728 aa  57  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  23 
 
 		 574 aa  53.5  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  25.13 
 
 		 595 aa  52.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  32.32 
 
 		 732 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  31.96 
 
 		 426 aa  50.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  31.34 
 
 		 426 aa  50.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  22.06 
 
 		 1100 aa  48.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  28.28 
 
 		 422 aa  47.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 		 422 aa  47.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  32.97 
 
 		 1021 aa  47.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  23.12 
 
 		 544 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 		 555 aa  46.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 554 aa  45.8  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 		 557 aa  45.8  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 593 aa  45.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2807  malto-oligosyltrehalose synthase  27.43 
 
 		 732 aa  45.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.212302  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  34.44 
 
 		 622 aa  45.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  23.67 
 
 		 564 aa  44.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>