103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5268 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
497 aa  991    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  56.67 
 
 
492 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  59.33 
 
 
484 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  41.05 
 
 
493 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  41.05 
 
 
493 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  43.79 
 
 
493 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  40.65 
 
 
513 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  43.91 
 
 
482 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  41.08 
 
 
480 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  37.78 
 
 
485 aa  324  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  41.12 
 
 
480 aa  312  9e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  42.64 
 
 
505 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  41.22 
 
 
481 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  41.12 
 
 
493 aa  297  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  42.28 
 
 
481 aa  296  8e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  27.42 
 
 
1214 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  23.8 
 
 
1118 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  23.98 
 
 
1118 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  25.26 
 
 
1101 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  26.17 
 
 
1153 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  24.96 
 
 
1193 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 
1177 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  23.93 
 
 
1181 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  26.45 
 
 
1173 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 
1231 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  25.46 
 
 
1253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  24.21 
 
 
1201 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  24.04 
 
 
1167 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  26.14 
 
 
1229 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 
1186 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  24.24 
 
 
1165 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 
1172 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 
1128 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  24.31 
 
 
1164 aa  104  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  24.9 
 
 
1202 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  24.83 
 
 
1144 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  23.87 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  23.7 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  26.02 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  28.02 
 
 
574 aa  70.5  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  25.5 
 
 
565 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  24.81 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  26.22 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  26.2 
 
 
426 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  22.07 
 
 
460 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  25.79 
 
 
1048 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  23.04 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
579 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  29.37 
 
 
758 aa  63.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 
467 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  25.89 
 
 
463 aa  58.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 
529 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01070  hypothetical protein  37.74 
 
 
109 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 
581 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 
728 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  25.49 
 
 
434 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  28.5 
 
 
614 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  28.22 
 
 
583 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  27.92 
 
 
448 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  27.63 
 
 
1122 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  29.81 
 
 
650 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  24.93 
 
 
546 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 
413 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 
1126 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  26.18 
 
 
441 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  25.71 
 
 
624 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 
541 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  27.16 
 
 
1122 aa  47  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  21.67 
 
 
515 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  26.18 
 
 
630 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  27.32 
 
 
682 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 
479 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  32.79 
 
 
536 aa  47  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1967  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 
536 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000720647  hitchhiker  0.000000000127887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 
528 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.63 
 
 
459 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  24.12 
 
 
427 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  27.39 
 
 
630 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 
547 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  29.28 
 
 
708 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  24.34 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  24.34 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  24.02 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  24.53 
 
 
541 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  38.6 
 
 
646 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  24.34 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  26.6 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  23.51 
 
 
402 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  38.6 
 
 
645 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  23.48 
 
 
450 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  29.94 
 
 
709 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  26.17 
 
 
635 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  25.94 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  22.9 
 
 
575 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 
1124 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 
752 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  25.61 
 
 
420 aa  43.9  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  26.79 
 
 
673 aa  43.5  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>