More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4079 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  100 
 
 		 513 aa  1071    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  56.52 
 
 		 493 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  56.52 
 
 		 493 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  54.94 
 
 		 493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  42.33 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  40.65 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  37.95 
 
 		 482 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  36.46 
 
 		 485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  38.71 
 
 		 493 aa  299  6e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  37.08 
 
 		 484 aa  299  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  38.1 
 
 		 480 aa  295  9e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  36.27 
 
 		 505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  36.86 
 
 		 481 aa  280  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  35.38 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  35.86 
 
 		 481 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  26.3 
 
 		 1202 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  24.28 
 
 		 1177 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  23.72 
 
 		 1101 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  26.51 
 
 		 1231 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  25.32 
 
 		 1165 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  24.6 
 
 		 1229 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  24.66 
 
 		 1214 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 		 1173 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  24.74 
 
 		 1181 aa  123  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  23.92 
 
 		 1144 aa  120  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  25.88 
 
 		 1193 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 1172 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  25.39 
 
 		 1153 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  24.2 
 
 		 1253 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  23.41 
 
 		 1167 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  23.18 
 
 		 1118 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  23.22 
 
 		 1118 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 		 1128 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  22.76 
 
 		 1186 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  23.38 
 
 		 1201 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  21.99 
 
 		 1164 aa  110  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  28.96 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01070  hypothetical protein  44.55 
 
 		 109 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  24.62 
 
 		 478 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  21.66 
 
 		 426 aa  87.8  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  23.1 
 
 		 624 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  24.87 
 
 		 758 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  26.14 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  21.8 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  28.68 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  22.72 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  24.43 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 687 aa  73.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  22.03 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 579 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 728 aa  71.2  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  22.05 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  21.01 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  27.92 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  24 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.41 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  27.82 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  27.46 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  26.65 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  25.57 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 574 aa  63.9  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  29.43 
 
 		 583 aa  63.5  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  23.19 
 
 		 676 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  28 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24.55 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  26.24 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  28.42 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  22.2 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  21.69 
 
 		 630 aa  60.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  22.01 
 
 		 626 aa  60.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  25.81 
 
 		 682 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  25.39 
 
 		 654 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 1124 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  25.48 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  26.3 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 1124 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  24.26 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  24.08 
 
 		 1124 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  30.81 
 
 		 448 aa  57  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  27.53 
 
 		 598 aa  57  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  25.08 
 
 		 1201 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 		 583 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  24.14 
 
 		 1154 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 		 540 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 		 258 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 1122 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  24.42 
 
 		 1122 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  22.81 
 
 		 581 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  30.18 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.34 
 
 		 551 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  24.91 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  22.41 
 
 		 653 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  29.79 
 
 		 560 aa  55.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>