More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2206 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  56.53 
 
 		 673 aa  755    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  56.46 
 
 		 581 aa  645    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  62.04 
 
 		 630 aa  706    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  56.87 
 
 		 761 aa  741    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  56.52 
 
 		 766 aa  742    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  57.77 
 
 		 624 aa  739    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  60.92 
 
 		 653 aa  746    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  58.71 
 
 		 736 aa  748    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  60.13 
 
 		 650 aa  734    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  59.75 
 
 		 704 aa  769    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  60.38 
 
 		 709 aa  771    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  59.85 
 
 		 676 aa  780    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 668 aa  1375    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  59.59 
 
 		 709 aa  759    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  56.82 
 
 		 715 aa  741    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  65.23 
 
 		 667 aa  818    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  56.51 
 
 		 610 aa  707    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  51.53 
 
 		 626 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  43.66 
 
 		 579 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  43.54 
 
 		 565 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  39.5 
 
 		 534 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  33.4 
 
 		 574 aa  243  9e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 459 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  22.68 
 
 		 1891 aa  81.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.96 
 
 		 1975 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  23.17 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 582 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.22 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  26.89 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  21.65 
 
 		 481 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  21.43 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.81 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  25.98 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  21.88 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  26.34 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  26.34 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  22.64 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  25.67 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  21.38 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  22.97 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  27.45 
 
 		 644 aa  66.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  25.95 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  21.09 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  24.69 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  25.76 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  22.76 
 
 		 654 aa  63.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  26.97 
 
 		 728 aa  63.9  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  36.36 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 682 aa  62  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  24.13 
 
 		 475 aa  62  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  22.4 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  27.56 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  23.95 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  30.32 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  22.2 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 		 493 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 451 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 		 493 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.3 
 
 		 2068 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  24.46 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  25.08 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.42 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  26.17 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  26.84 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  21.26 
 
 		 1093 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  37.19 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  22.93 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  25.91 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  23.64 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  23.03 
 
 		 914 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  30.91 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  20.63 
 
 		 562 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  30.5 
 
 		 604 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  29.48 
 
 		 455 aa  57  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 426 aa  57  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  23.74 
 
 		 528 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  31.48 
 
 		 413 aa  57  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  30.71 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  21.47 
 
 		 543 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  29.27 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.76 
 
 		 509 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  22.5 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  22.52 
 
 		 479 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 		 541 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  22.33 
 
 		 479 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  22.91 
 
 		 524 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 		 671 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  22.04 
 
 		 575 aa  55.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 		 586 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 1037 aa  55.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  22.16 
 
 		 647 aa  54.7  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  27.18 
 
 		 586 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  22.26 
 
 		 538 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  23.8 
 
 		 493 aa  54.7  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  27.18 
 
 		 586 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  25.5 
 
 		 571 aa  54.7  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>