152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0792 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 482 aa  1006    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  64.17 
 
 		 481 aa  670    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  59.38 
 
 		 493 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  57.08 
 
 		 480 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  56.07 
 
 		 480 aa  568  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  56.25 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  56.16 
 
 		 481 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  40.59 
 
 		 492 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  43.91 
 
 		 497 aa  322  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  38.33 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  37.95 
 
 		 513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  42.25 
 
 		 493 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  40.5 
 
 		 493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  40.5 
 
 		 493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  39.6 
 
 		 485 aa  289  7e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  30.17 
 
 		 1202 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  26.97 
 
 		 1177 aa  160  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  26.29 
 
 		 1214 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  27.32 
 
 		 1101 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 1229 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  25.14 
 
 		 1231 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 1118 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  27.49 
 
 		 1118 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 1181 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  27.52 
 
 		 1153 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 1186 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  23.44 
 
 		 1167 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  26.36 
 
 		 1201 aa  146  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  26.28 
 
 		 1172 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  27.14 
 
 		 1128 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  26.6 
 
 		 1193 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 1164 aa  140  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  26.8 
 
 		 1253 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  25.37 
 
 		 1173 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  26.55 
 
 		 1144 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  25.56 
 
 		 1165 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  24.14 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  23.89 
 
 		 434 aa  91.3  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  27.76 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  25.9 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  25.81 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  27.02 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 579 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  24.71 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  26.82 
 
 		 581 aa  71.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  25.94 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  20.11 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  27.04 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  23.44 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  23.73 
 
 		 650 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  25.74 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  25.74 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  23.66 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  21.61 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  29.27 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  22.13 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  23.26 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  25.37 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  24.08 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  23.93 
 
 		 704 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 641 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  23.53 
 
 		 624 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  23.72 
 
 		 709 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  25.37 
 
 		 758 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  22.72 
 
 		 761 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  22.77 
 
 		 653 aa  54.7  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  22.99 
 
 		 709 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  30.38 
 
 		 663 aa  53.9  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 708 aa  53.5  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  20.95 
 
 		 499 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  21.33 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  26.89 
 
 		 678 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  23.86 
 
 		 1201 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  23.51 
 
 		 524 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  23.51 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  25.1 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  23.26 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  22.14 
 
 		 541 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.69 
 
 		 836 aa  52  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  22.91 
 
 		 667 aa  51.2  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  23.44 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  23.33 
 
 		 479 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  24.73 
 
 		 481 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 1196 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 1196 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  23.63 
 
 		 547 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  22.25 
 
 		 728 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  22.2 
 
 		 541 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 		 533 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  21.94 
 
 		 654 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  25.93 
 
 		 638 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  22.93 
 
 		 524 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  27.95 
 
 		 672 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  25.37 
 
 		 643 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>