More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2303 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  73.05 
 
 		 673 aa  1001    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  56.43 
 
 		 624 aa  749    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  56.16 
 
 		 653 aa  743    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 761 aa  1578    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  54.8 
 
 		 650 aa  762    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  51.85 
 
 		 581 aa  654    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  95.43 
 
 		 766 aa  1490    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  53.04 
 
 		 630 aa  686    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  70.86 
 
 		 704 aa  1009    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  70.64 
 
 		 709 aa  1008    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  61.02 
 
 		 676 aa  820    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  70.21 
 
 		 709 aa  1004    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  95.12 
 
 		 715 aa  1407    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  57.58 
 
 		 667 aa  793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  95.94 
 
 		 736 aa  1463    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  56.87 
 
 		 668 aa  741    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  55.33 
 
 		 610 aa  732    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  53.27 
 
 		 626 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  42.68 
 
 		 579 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  42.57 
 
 		 565 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  36.27 
 
 		 534 aa  364  4e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 		 574 aa  240  5.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  24.68 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  28.65 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  28.65 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  28.65 
 
 		 433 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  28.1 
 
 		 434 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  39.51 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  32.47 
 
 		 434 aa  62  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  27.67 
 
 		 544 aa  62  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  27.49 
 
 		 464 aa  62  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  22.1 
 
 		 654 aa  60.8  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  29.52 
 
 		 478 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  31.82 
 
 		 426 aa  60.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  21.38 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  26.61 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  22.55 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  27.31 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  28.42 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 		 1126 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  28.7 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  39.18 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  36.75 
 
 		 712 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  29.03 
 
 		 480 aa  57.4  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  28.36 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  27.91 
 
 		 442 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 752 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  38.14 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  38.14 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 413 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 566 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 481 aa  56.6  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 1124 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 1124 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  38.14 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  24.71 
 
 		 459 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  27.4 
 
 		 532 aa  55.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  21.77 
 
 		 522 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 		 1124 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  38.14 
 
 		 713 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  38.14 
 
 		 713 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  29.91 
 
 		 734 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  38.14 
 
 		 713 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  25.71 
 
 		 534 aa  55.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  24.09 
 
 		 481 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  29.41 
 
 		 511 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  28.89 
 
 		 538 aa  55.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  32.58 
 
 		 542 aa  55.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  29.45 
 
 		 572 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  30.22 
 
 		 426 aa  55.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  28.16 
 
 		 671 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  29.91 
 
 		 715 aa  55.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 1074 aa  54.7  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 1075 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  28.16 
 
 		 724 aa  54.3  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  25.26 
 
 		 484 aa  54.3  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  35.44 
 
 		 413 aa  54.3  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  28.97 
 
 		 544 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  34.68 
 
 		 713 aa  54.3  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  26.74 
 
 		 488 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3678  alpha amylase, catalytic region  39.34 
 
 		 672 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.28 
 
 		 1975 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  21.35 
 
 		 1855 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  21.52 
 
 		 574 aa  53.5  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  32.69 
 
 		 467 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  26.71 
 
 		 541 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  27.48 
 
 		 560 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  26.03 
 
 		 542 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  26 
 
 		 640 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  37.11 
 
 		 713 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1052  alpha amylase catalytic region  37.7 
 
 		 672 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.49 
 
 		 560 aa  53.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  27.4 
 
 		 555 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  25.32 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 		 486 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  28.15 
 
 		 538 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>