More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2314 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  84.17 
 
 		 673 aa  1184    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  59.59 
 
 		 668 aa  759    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  70.04 
 
 		 736 aa  1016    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  74.46 
 
 		 761 aa  1001    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  55.8 
 
 		 630 aa  691    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  58.17 
 
 		 624 aa  750    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  60.37 
 
 		 653 aa  752    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  59.05 
 
 		 650 aa  766    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  92.24 
 
 		 704 aa  1360    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  92.81 
 
 		 709 aa  1377    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  61.86 
 
 		 676 aa  818    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 709 aa  1469    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  74.65 
 
 		 715 aa  1012    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  53.47 
 
 		 581 aa  650    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  58.16 
 
 		 667 aa  793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  74.04 
 
 		 766 aa  1007    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  56.29 
 
 		 610 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  51.36 
 
 		 626 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  44.39 
 
 		 579 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  42.48 
 
 		 565 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  36.81 
 
 		 534 aa  352  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  29.78 
 
 		 574 aa  244  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  24.14 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  35.61 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  24.34 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  24.34 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  24.3 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  24.27 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  28.12 
 
 		 663 aa  62  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  21.46 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  32.58 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  22.36 
 
 		 488 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  30.3 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 533 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  28.81 
 
 		 464 aa  60.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  30.3 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  30.3 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  22.05 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  30.63 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  27.14 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  38.33 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  48.39 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  36.84 
 
 		 713 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  28.05 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0161  alpha amylase, catalytic region  23.79 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00960046  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0159  hypothetical protein  23.79 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00185609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  21.82 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  28.04 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  21.55 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  36.84 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  25.58 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  28.81 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  36.84 
 
 		 713 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 532 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 566 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.26 
 
 		 610 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  26.49 
 
 		 538 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.03 
 
 		 1855 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  35.96 
 
 		 713 aa  55.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  38.78 
 
 		 713 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  36.84 
 
 		 713 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  35.96 
 
 		 713 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  35.96 
 
 		 713 aa  55.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  36.84 
 
 		 713 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  23.45 
 
 		 1942 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 		 413 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  28 
 
 		 586 aa  55.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  25.71 
 
 		 534 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  30.43 
 
 		 459 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  26.49 
 
 		 610 aa  55.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 		 483 aa  54.7  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  23.81 
 
 		 758 aa  54.3  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 599 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  24.01 
 
 		 728 aa  53.9  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  25.9 
 
 		 558 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  36.29 
 
 		 713 aa  53.9  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  24.11 
 
 		 493 aa  53.5  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  29.55 
 
 		 604 aa  53.9  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  21.21 
 
 		 509 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  20.68 
 
 		 1401 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 		 486 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  24.73 
 
 		 692 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  28.45 
 
 		 688 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  27.87 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  22.15 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  22.62 
 
 		 522 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  28.04 
 
 		 601 aa  53.1  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  20.87 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  30.23 
 
 		 572 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  24.55 
 
 		 593 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  28.04 
 
 		 1131 aa  52.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  27.48 
 
 		 522 aa  52.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  30.37 
 
 		 542 aa  52.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  24.31 
 
 		 544 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 1130 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  22.66 
 
 		 1975 aa  52  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>