More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0897 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  100 
 
 		 534 aa  1118    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  51.14 
 
 		 565 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  52.31 
 
 		 579 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  42.61 
 
 		 581 aa  401  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  41.03 
 
 		 667 aa  392  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  40.87 
 
 		 630 aa  392  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  40.52 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  40.6 
 
 		 676 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  38.49 
 
 		 610 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  39.64 
 
 		 624 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  40.15 
 
 		 653 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  39.68 
 
 		 668 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  36.27 
 
 		 761 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  37.48 
 
 		 673 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  36.13 
 
 		 715 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  35.97 
 
 		 766 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  36.27 
 
 		 736 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  36.81 
 
 		 709 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  37.33 
 
 		 704 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  36.81 
 
 		 709 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  41.7 
 
 		 626 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  38.79 
 
 		 574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  28.92 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  26.65 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  25.56 
 
 		 422 aa  95.1  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  25.51 
 
 		 422 aa  93.6  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  23.2 
 
 		 426 aa  87.8  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  27.18 
 
 		 515 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  26.3 
 
 		 478 aa  86.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  22.08 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  25.45 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.86 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  27.32 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  23.74 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  28.68 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  25.61 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  25.61 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  25.67 
 
 		 433 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  26.3 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  24.49 
 
 		 664 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  25.82 
 
 		 1133 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  24.82 
 
 		 651 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  25.82 
 
 		 1136 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  28.92 
 
 		 434 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  24.49 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  28.92 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 		 671 aa  70.5  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  24.46 
 
 		 684 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  28.16 
 
 		 1130 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  27.57 
 
 		 667 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  29.34 
 
 		 1130 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  29.34 
 
 		 1130 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  25.81 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  25.45 
 
 		 734 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 1126 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  23.42 
 
 		 672 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  26.02 
 
 		 1075 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  22.22 
 
 		 1074 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  24.81 
 
 		 497 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  26.38 
 
 		 493 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  38.67 
 
 		 724 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  27.57 
 
 		 1122 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  25.09 
 
 		 1122 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  37.33 
 
 		 708 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  28.93 
 
 		 1130 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  25.25 
 
 		 1942 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 		 1124 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  26.26 
 
 		 1201 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  27.69 
 
 		 1131 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 		 1124 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  25.29 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  40.85 
 
 		 651 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  25.98 
 
 		 1196 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  25.98 
 
 		 1196 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  26.71 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  23.91 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  38.96 
 
 		 1144 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  23.55 
 
 		 1124 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  36.78 
 
 		 1146 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  35.63 
 
 		 1151 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  24.82 
 
 		 1148 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  25.71 
 
 		 1005 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  24.03 
 
 		 672 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.86 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  24.82 
 
 		 1115 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  24.82 
 
 		 1115 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  27.74 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  29.58 
 
 		 1038 aa  61.6  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  24.58 
 
 		 1082 aa  61.6  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  26.86 
 
 		 1022 aa  61.6  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  25 
 
 		 1115 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  25 
 
 		 1136 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  25 
 
 		 1115 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  37.33 
 
 		 660 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  23.14 
 
 		 657 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  24.39 
 
 		 657 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  24.53 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>