More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2593 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  55.33 
 
 		 761 aa  731    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  56.2 
 
 		 673 aa  736    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  54.14 
 
 		 766 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  61.43 
 
 		 581 aa  766    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  57.93 
 
 		 624 aa  759    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  59.33 
 
 		 653 aa  707    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  60.61 
 
 		 630 aa  730    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  59.8 
 
 		 650 aa  748    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  56.51 
 
 		 668 aa  707    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  56.76 
 
 		 704 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  56.13 
 
 		 709 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  57.51 
 
 		 676 aa  755    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  56.29 
 
 		 709 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  55.18 
 
 		 736 aa  727    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  54.6 
 
 		 715 aa  730    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  57.64 
 
 		 667 aa  736    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 610 aa  1261    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  48.91 
 
 		 579 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  53.86 
 
 		 626 aa  532  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  46.67 
 
 		 565 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  38.49 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  34.16 
 
 		 574 aa  258  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.51 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.23 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.22 
 
 		 1975 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  22.92 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  31.52 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.48 
 
 		 2068 aa  67.4  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  29.93 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  21.27 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  25.58 
 
 		 644 aa  64.3  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  22.81 
 
 		 724 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 499 aa  62  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  33.65 
 
 		 715 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  33.65 
 
 		 734 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  21.55 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  34.59 
 
 		 434 aa  60.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  22.4 
 
 		 477 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 258 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  21.55 
 
 		 588 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  22 
 
 		 2638 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  23.01 
 
 		 752 aa  59.7  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  23.45 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  24.23 
 
 		 758 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  29.6 
 
 		 1151 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  30.65 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  22.26 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 662 aa  57.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  35.59 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  26.79 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  28.78 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  22.41 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  22.41 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  28.8 
 
 		 1146 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  29.14 
 
 		 563 aa  57  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 670 aa  57  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  29.36 
 
 		 667 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  31.19 
 
 		 672 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  22.24 
 
 		 493 aa  57  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  20.81 
 
 		 607 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  28.8 
 
 		 708 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  22.54 
 
 		 481 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  28 
 
 		 1037 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  28 
 
 		 1144 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  31.19 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.06 
 
 		 1891 aa  56.2  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 		 622 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  28.8 
 
 		 1130 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  22.92 
 
 		 524 aa  56.2  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  24.31 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  28.29 
 
 		 544 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  28.1 
 
 		 563 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  25 
 
 		 544 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  30.28 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.13 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  22.18 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 540 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  28 
 
 		 1130 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  30.48 
 
 		 671 aa  55.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  34.83 
 
 		 1124 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  34.83 
 
 		 1124 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  26.94 
 
 		 434 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  28.99 
 
 		 604 aa  55.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  27.2 
 
 		 660 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  29.09 
 
 		 1130 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  22.66 
 
 		 586 aa  54.7  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  32.04 
 
 		 671 aa  54.7  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  27.15 
 
 		 1136 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 1133 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  29.09 
 
 		 1130 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  28.4 
 
 		 413 aa  54.3  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  28.71 
 
 		 651 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.07 
 
 		 560 aa  54.3  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  27.11 
 
 		 442 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  23.32 
 
 		 1942 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  34.83 
 
 		 1124 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  29.68 
 
 		 433 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  29.68 
 
 		 433 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>