More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2030 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  77.17 
 
 
643 aa  1020    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  62.71 
 
 
642 aa  753    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  53.69 
 
 
652 aa  674    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
638 aa  1316    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  64.23 
 
 
672 aa  789    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  51.74 
 
 
650 aa  625  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  48.59 
 
 
649 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  48.34 
 
 
646 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  47.97 
 
 
645 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  48.13 
 
 
663 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  47.14 
 
 
641 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  43.82 
 
 
661 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  45.39 
 
 
636 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  45.75 
 
 
667 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  42.24 
 
 
651 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  44.16 
 
 
644 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  40.69 
 
 
650 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  41.24 
 
 
650 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  40.99 
 
 
651 aa  485  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  42.35 
 
 
657 aa  478  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  43.79 
 
 
639 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  43.51 
 
 
650 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  42.27 
 
 
645 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  39.12 
 
 
638 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.18 
 
 
1085 aa  199  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  28.42 
 
 
553 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  28.77 
 
 
534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  26.97 
 
 
1094 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  26.49 
 
 
1088 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  26.49 
 
 
1088 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  27.27 
 
 
1088 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  26.13 
 
 
1088 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  26.81 
 
 
551 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  25.88 
 
 
1092 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.85 
 
 
551 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  27.83 
 
 
567 aa  183  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  26.53 
 
 
1102 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  26.53 
 
 
1102 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  26.22 
 
 
1100 aa  182  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  26.53 
 
 
1102 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  26.64 
 
 
556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  27.04 
 
 
1100 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  26.3 
 
 
1154 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  26.38 
 
 
1154 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  26.84 
 
 
1100 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  26.79 
 
 
1100 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  27.34 
 
 
572 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  26.23 
 
 
1152 aa  180  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  24.6 
 
 
1114 aa  180  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  25.59 
 
 
1104 aa  180  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  25.27 
 
 
1088 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  27.34 
 
 
553 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  25.45 
 
 
1088 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  27.34 
 
 
572 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  27.33 
 
 
1101 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  24.32 
 
 
1109 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  26.77 
 
 
1094 aa  179  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  28.4 
 
 
1098 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  27.09 
 
 
1121 aa  178  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  27.22 
 
 
1099 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  28.08 
 
 
1098 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  25.73 
 
 
548 aa  177  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  25.53 
 
 
1100 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  27.31 
 
 
1136 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  27.25 
 
 
1100 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  26.53 
 
 
1099 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 
1138 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  25.7 
 
 
1105 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  27.78 
 
 
1164 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  27.78 
 
 
1164 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  26.92 
 
 
1137 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  25.59 
 
 
1115 aa  174  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  26.82 
 
 
1095 aa  173  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  24.51 
 
 
1142 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  25.19 
 
 
1116 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  25 
 
 
1116 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  26.69 
 
 
1110 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  26.56 
 
 
1101 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  25.41 
 
 
1100 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  25.88 
 
 
1098 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  26.73 
 
 
1137 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  26.9 
 
 
585 aa  171  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  26.73 
 
 
1137 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  26.73 
 
 
1137 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  26.73 
 
 
1137 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  24.82 
 
 
1113 aa  171  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  25.81 
 
 
1098 aa  170  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  24.65 
 
 
1112 aa  171  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  28.34 
 
 
591 aa  170  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  25.55 
 
 
1111 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  25.94 
 
 
1160 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  26.54 
 
 
1131 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  26.54 
 
 
1131 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  26.54 
 
 
1131 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  24.71 
 
 
1113 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  26.54 
 
 
1131 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  26.33 
 
 
1139 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  26.54 
 
 
1131 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  25.63 
 
 
1112 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  26.09 
 
 
588 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>