More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1267 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  63.25 
 
 
639 aa  753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  58.26 
 
 
650 aa  673    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  55.81 
 
 
644 aa  682    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
645 aa  1281    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  55.06 
 
 
636 aa  689    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  47.99 
 
 
657 aa  576  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  43.71 
 
 
661 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  47.79 
 
 
667 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  44.34 
 
 
652 aa  505  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  38 
 
 
650 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  41.37 
 
 
650 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  45.03 
 
 
643 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  38.77 
 
 
650 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  45.73 
 
 
672 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  42.27 
 
 
638 aa  458  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  38.33 
 
 
651 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  37.4 
 
 
645 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  38.49 
 
 
651 aa  438  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  45.35 
 
 
642 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  39.21 
 
 
646 aa  435  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  39.93 
 
 
663 aa  423  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  41.34 
 
 
638 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  35.31 
 
 
649 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  38.7 
 
 
641 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  28.29 
 
 
1085 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  28.8 
 
 
553 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  29.4 
 
 
551 aa  177  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  28.47 
 
 
572 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  31.04 
 
 
1100 aa  174  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  28.28 
 
 
553 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  23.51 
 
 
534 aa  173  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  28.28 
 
 
572 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  27 
 
 
1094 aa  173  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  29.05 
 
 
551 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  27.96 
 
 
1121 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  25.81 
 
 
682 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  24.96 
 
 
601 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  31.88 
 
 
1099 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  31.3 
 
 
1093 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  31.3 
 
 
1093 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  26.85 
 
 
556 aa  169  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  31.11 
 
 
1101 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  29.24 
 
 
567 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  30.59 
 
 
1139 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  29.56 
 
 
1154 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  28.94 
 
 
1088 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  29.31 
 
 
1152 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.38 
 
 
1154 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  30.75 
 
 
1101 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  29.82 
 
 
1100 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  26.94 
 
 
1088 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  28.94 
 
 
1094 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  26.58 
 
 
1088 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  26.58 
 
 
1088 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  26.96 
 
 
1110 aa  164  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  29.05 
 
 
1112 aa  163  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  29 
 
 
1123 aa  163  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  26.54 
 
 
1092 aa  163  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  29.49 
 
 
1100 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  26.08 
 
 
606 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  25.76 
 
 
1100 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  29.74 
 
 
1164 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  29.74 
 
 
1164 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  30.33 
 
 
1108 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  29.01 
 
 
1121 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  27.33 
 
 
1108 aa  162  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  28.61 
 
 
1111 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  27.19 
 
 
1113 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  26.14 
 
 
1142 aa  162  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  30.1 
 
 
1100 aa  161  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  26.41 
 
 
577 aa  161  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  26.82 
 
 
1061 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  30.15 
 
 
616 aa  160  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  26 
 
 
591 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  29.56 
 
 
1100 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  25.4 
 
 
567 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  30.93 
 
 
604 aa  160  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  27.05 
 
 
1105 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  29.02 
 
 
1160 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  31.23 
 
 
558 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  28.28 
 
 
1116 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  28.83 
 
 
1110 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  26.12 
 
 
1134 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  24.19 
 
 
1114 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  31.3 
 
 
1108 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  25.8 
 
 
1102 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  28.12 
 
 
1136 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  28.28 
 
 
1116 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  26.81 
 
 
598 aa  158  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  28.52 
 
 
556 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  27.59 
 
 
548 aa  158  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  30.26 
 
 
1137 aa  158  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  25.72 
 
 
1102 aa  158  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  29.16 
 
 
1115 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  28.06 
 
 
601 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  28.61 
 
 
1119 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  30.33 
 
 
596 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  29.34 
 
 
1099 aa  157  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  30.33 
 
 
596 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  30.33 
 
 
596 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>