More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1690 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  56.75 
 
 
636 aa  696    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  56.68 
 
 
650 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
639 aa  1292    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  64.6 
 
 
645 aa  728    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  59.64 
 
 
644 aa  727    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  51.6 
 
 
657 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  44.48 
 
 
661 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  48.21 
 
 
667 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  45.95 
 
 
652 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  48.13 
 
 
643 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  48.31 
 
 
672 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  43.79 
 
 
638 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  37.13 
 
 
650 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  39.76 
 
 
650 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  42.59 
 
 
645 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  41.79 
 
 
650 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  37.68 
 
 
651 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  40.87 
 
 
663 aa  454  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  40.8 
 
 
651 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  39.5 
 
 
649 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  41.99 
 
 
642 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  37.66 
 
 
646 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  46.2 
 
 
638 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  38.32 
 
 
641 aa  392  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 
534 aa  197  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  30.23 
 
 
551 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  29.47 
 
 
553 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  29.24 
 
 
553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  29.24 
 
 
572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  28.12 
 
 
551 aa  183  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  29.32 
 
 
572 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  30.78 
 
 
587 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  28.63 
 
 
1154 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  29.61 
 
 
598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  28.72 
 
 
1152 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  29.5 
 
 
1108 aa  180  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  29.31 
 
 
1111 aa  178  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  30.47 
 
 
1099 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  28.57 
 
 
598 aa  177  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  29.47 
 
 
585 aa  177  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.41 
 
 
1154 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  28.7 
 
 
556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.3 
 
 
1088 aa  174  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  29.49 
 
 
1100 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.3 
 
 
1088 aa  174  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  27.19 
 
 
1092 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  28.17 
 
 
1112 aa  173  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  28.82 
 
 
1139 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  28.48 
 
 
1088 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  28.39 
 
 
1116 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  30.02 
 
 
1101 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  33.23 
 
 
1109 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  30.08 
 
 
567 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  27.72 
 
 
1088 aa  172  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  29.65 
 
 
1123 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  28.39 
 
 
1116 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  28.54 
 
 
1085 aa  171  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.05 
 
 
1136 aa  171  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  29.05 
 
 
1137 aa  171  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  29.05 
 
 
1137 aa  171  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  29.05 
 
 
1137 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  28.71 
 
 
556 aa  170  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  28.83 
 
 
1137 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  28.08 
 
 
548 aa  170  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  28.63 
 
 
1104 aa  170  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  28.88 
 
 
1112 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  28.83 
 
 
1137 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  29.96 
 
 
591 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  27.82 
 
 
1088 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  28.99 
 
 
588 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  28.54 
 
 
571 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  28.8 
 
 
601 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 
1138 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  28.51 
 
 
1100 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  27.9 
 
 
1100 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  27.94 
 
 
1119 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  27.46 
 
 
567 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  29.65 
 
 
583 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  28.75 
 
 
1100 aa  167  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  28.86 
 
 
1113 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  28.29 
 
 
1100 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  29.5 
 
 
1101 aa  166  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  29.86 
 
 
1160 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  29.86 
 
 
1164 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  29.86 
 
 
1164 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  28.33 
 
 
1110 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  26.93 
 
 
601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  27.13 
 
 
1094 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  27.96 
 
 
1094 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  27.68 
 
 
1098 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  28.43 
 
 
1100 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  29.16 
 
 
606 aa  165  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  29.25 
 
 
1105 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  28.44 
 
 
616 aa  165  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  31.59 
 
 
1134 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  29.35 
 
 
1098 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  26.98 
 
 
1098 aa  165  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  32.39 
 
 
558 aa  165  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  28.54 
 
 
1108 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  27.19 
 
 
1088 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>