More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3590 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  52.56 
 
 
657 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
661 aa  1376    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  48.6 
 
 
644 aa  608  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  47.63 
 
 
650 aa  581  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  46.34 
 
 
636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  48.12 
 
 
652 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  46.15 
 
 
667 aa  569  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  46.7 
 
 
650 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  44.31 
 
 
663 aa  536  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  43.44 
 
 
650 aa  535  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  43.82 
 
 
638 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  43.59 
 
 
650 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  43.93 
 
 
651 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  44.48 
 
 
639 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  43.8 
 
 
643 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  43.48 
 
 
645 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  44.5 
 
 
672 aa  508  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  41.89 
 
 
651 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  43.01 
 
 
642 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  40.75 
 
 
646 aa  475  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  39.65 
 
 
649 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  40.29 
 
 
645 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  42 
 
 
638 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  39.6 
 
 
641 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 
534 aa  178  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  27.49 
 
 
572 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  27.66 
 
 
553 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  28.44 
 
 
553 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  27.31 
 
 
572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  27.53 
 
 
551 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  26.97 
 
 
551 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  26.23 
 
 
1100 aa  170  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  26.68 
 
 
1100 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  26.87 
 
 
1100 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  28.65 
 
 
1085 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.49 
 
 
1088 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  27.1 
 
 
1099 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  28.06 
 
 
1100 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  29.7 
 
 
1088 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  29.1 
 
 
1088 aa  164  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  29.1 
 
 
1088 aa  164  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  25.82 
 
 
1088 aa  163  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  27.99 
 
 
1098 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  26.03 
 
 
1094 aa  160  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  26.36 
 
 
1101 aa  160  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  27.56 
 
 
1088 aa  160  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.47 
 
 
1092 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  28.23 
 
 
1099 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  27.91 
 
 
1094 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  27.48 
 
 
1100 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  26.73 
 
 
1098 aa  157  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  25.04 
 
 
548 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  25.05 
 
 
571 aa  156  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  26.79 
 
 
1152 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  25.33 
 
 
1110 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  26.99 
 
 
1100 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  26.15 
 
 
567 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  25.05 
 
 
1104 aa  154  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  26.23 
 
 
601 aa  154  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  25.93 
 
 
1108 aa  154  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  24.58 
 
 
1098 aa  154  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  26.43 
 
 
585 aa  153  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  27.94 
 
 
1101 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  28.47 
 
 
1108 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.29 
 
 
1121 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  28.54 
 
 
1110 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  25.93 
 
 
567 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  25 
 
 
587 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  26.08 
 
 
1105 aa  150  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  25 
 
 
1102 aa  151  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  26.17 
 
 
1115 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  24.72 
 
 
1102 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  27.23 
 
 
1111 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  25.71 
 
 
591 aa  150  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  28.88 
 
 
558 aa  150  9e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  27.15 
 
 
1136 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  25.23 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  26.86 
 
 
1131 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  27.77 
 
 
1109 aa  150  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  26.86 
 
 
1131 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  26.86 
 
 
1131 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  26.86 
 
 
1131 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  26.86 
 
 
1131 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  27.71 
 
 
1061 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  24.72 
 
 
1102 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  25.37 
 
 
1154 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  27.78 
 
 
1137 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  26 
 
 
1164 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  26 
 
 
1164 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  26.92 
 
 
1093 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  27.87 
 
 
1123 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  25.74 
 
 
606 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  27.1 
 
 
1112 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  24.48 
 
 
1114 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  27.31 
 
 
1137 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  27.31 
 
 
1137 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  27.13 
 
 
1100 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  26.91 
 
 
577 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  28.07 
 
 
1105 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  27.31 
 
 
1137 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>