More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  56.59 
 
 
652 aa  675    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  57.33 
 
 
672 aa  699    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  100 
 
 
642 aa  1285    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  62.71 
 
 
638 aa  770    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  65.2 
 
 
643 aa  805    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  51.01 
 
 
650 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  46.57 
 
 
645 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  44.31 
 
 
649 aa  581  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  48.3 
 
 
663 aa  569  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  45.68 
 
 
646 aa  545  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  43.01 
 
 
661 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  44.6 
 
 
644 aa  511  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  44.15 
 
 
641 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  44.05 
 
 
657 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  45.34 
 
 
667 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  40.35 
 
 
650 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  45.71 
 
 
636 aa  477  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  46.64 
 
 
650 aa  466  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  38.08 
 
 
651 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  39.36 
 
 
651 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  39.9 
 
 
650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  41.99 
 
 
639 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  45.35 
 
 
645 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  39.04 
 
 
638 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  27.91 
 
 
534 aa  180  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  27.7 
 
 
1088 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  27.8 
 
 
1088 aa  176  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  27.8 
 
 
1088 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  27.24 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  28.01 
 
 
1092 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  28.29 
 
 
1085 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  28.19 
 
 
553 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  27.99 
 
 
601 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  27.58 
 
 
598 aa  171  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26.21 
 
 
567 aa  170  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  25.69 
 
 
551 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  27.47 
 
 
588 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  26.68 
 
 
591 aa  169  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  27.46 
 
 
571 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  28.82 
 
 
591 aa  166  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  25.63 
 
 
548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  27.46 
 
 
1104 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  27.29 
 
 
572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  27.4 
 
 
598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  25.86 
 
 
1114 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  32.32 
 
 
567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  28.75 
 
 
1098 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  28.46 
 
 
585 aa  165  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  26.89 
 
 
577 aa  165  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  27.29 
 
 
553 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  27.29 
 
 
572 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  27.5 
 
 
1100 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  26.43 
 
 
1099 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  26.49 
 
 
606 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  28.94 
 
 
1109 aa  164  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  26.79 
 
 
1088 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  27.39 
 
 
601 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  27.14 
 
 
1093 aa  163  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  25.72 
 
 
682 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  27.73 
 
 
610 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  29.16 
 
 
1098 aa  163  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  27.77 
 
 
582 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  27.39 
 
 
1099 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  25.98 
 
 
556 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  26.53 
 
 
1152 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.63 
 
 
1093 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  27.44 
 
 
1100 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  28.52 
 
 
1110 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  26.03 
 
 
1154 aa  160  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  27.09 
 
 
1108 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  26.45 
 
 
1088 aa  160  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  26.55 
 
 
1100 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  28.65 
 
 
1101 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  27.66 
 
 
1108 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  29.38 
 
 
1098 aa  159  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  26.02 
 
 
1100 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  28.92 
 
 
1142 aa  159  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  25.91 
 
 
1154 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  26.57 
 
 
1113 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  26.77 
 
 
1088 aa  158  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  28.62 
 
 
1061 aa  157  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  26.02 
 
 
1100 aa  157  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  28.5 
 
 
1100 aa  156  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  26.44 
 
 
551 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  29.31 
 
 
616 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  25.97 
 
 
1094 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  25.09 
 
 
1112 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  28.03 
 
 
1105 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  28.2 
 
 
559 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  27.78 
 
 
1106 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  27.78 
 
 
1106 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  26.06 
 
 
1100 aa  154  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  25.88 
 
 
1100 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  26.19 
 
 
604 aa  154  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.57 
 
 
1121 aa  153  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 
556 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  25.75 
 
 
1100 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  27.77 
 
 
1106 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  30.69 
 
 
596 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  27.72 
 
 
559 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>