More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1797 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  65.28 
 
 		 650 aa  914    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 651 aa  1354    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  64.51 
 
 		 650 aa  910    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  66.36 
 
 		 651 aa  940    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  44.98 
 
 		 652 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  41.88 
 
 		 644 aa  531  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  41.89 
 
 		 661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  42.53 
 
 		 636 aa  517  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  41.1 
 
 		 649 aa  507  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  42.24 
 
 		 638 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  40.25 
 
 		 657 aa  507  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  43.12 
 
 		 646 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  43.37 
 
 		 643 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  42.5 
 
 		 650 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  42.32 
 
 		 645 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  46.03 
 
 		 650 aa  491  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  40.72 
 
 		 663 aa  480  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  38.02 
 
 		 667 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  39.36 
 
 		 642 aa  459  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  40.41 
 
 		 672 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  40.07 
 
 		 641 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  40.8 
 
 		 639 aa  439  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  38.6 
 
 		 645 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  36.14 
 
 		 638 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  30.37 
 
 		 534 aa  226  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  27.02 
 
 		 553 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  31.78 
 
 		 571 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  28.37 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  28.37 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  28.37 
 
 		 596 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  27.49 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  29.85 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  27.07 
 
 		 1114 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  26.66 
 
 		 1088 aa  194  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  26.74 
 
 		 1088 aa  194  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  26.74 
 
 		 1088 aa  194  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  28.03 
 
 		 1100 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.71 
 
 		 551 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  28.09 
 
 		 601 aa  191  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  30.43 
 
 		 1094 aa  190  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  26.21 
 
 		 553 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  26.21 
 
 		 572 aa  190  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  27.62 
 
 		 1108 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  29.33 
 
 		 567 aa  189  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  26.24 
 
 		 572 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  27.27 
 
 		 1100 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.24 
 
 		 1085 aa  188  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  26.48 
 
 		 1092 aa  188  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  27.1 
 
 		 1100 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  27.45 
 
 		 1108 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  27.79 
 
 		 604 aa  187  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  28.41 
 
 		 558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  25.87 
 
 		 1104 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  26.71 
 
 		 1100 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  28.18 
 
 		 577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  27.51 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  26.57 
 
 		 1100 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  25.97 
 
 		 1093 aa  185  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  30 
 
 		 598 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  26.67 
 
 		 1110 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  26.12 
 
 		 1113 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  26.42 
 
 		 1061 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  24.91 
 
 		 1100 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.74 
 
 		 1152 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  26.79 
 
 		 606 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  26.23 
 
 		 1112 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  26.32 
 
 		 1109 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  26.56 
 
 		 1123 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  29.68 
 
 		 598 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  25.79 
 
 		 1088 aa  181  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.98 
 
 		 1121 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  27.59 
 
 		 616 aa  181  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  25.62 
 
 		 1093 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  27.27 
 
 		 1154 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  26.84 
 
 		 1100 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  27.23 
 
 		 567 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  27.4 
 
 		 591 aa  180  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  27.37 
 
 		 1099 aa  180  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  27.38 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  25.89 
 
 		 1121 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  26.6 
 
 		 1154 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  28.21 
 
 		 1100 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  26.4 
 
 		 1088 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  25.23 
 
 		 1111 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  30.51 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  26.43 
 
 		 1088 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  30.81 
 
 		 591 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  26.74 
 
 		 682 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  29.58 
 
 		 1101 aa  178  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  27.85 
 
 		 572 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  25.9 
 
 		 1115 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  30.55 
 
 		 583 aa  177  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  29.41 
 
 		 585 aa  177  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  29.51 
 
 		 588 aa  176  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  25.91 
 
 		 1139 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  25.57 
 
 		 1113 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  26.45 
 
 		 1136 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  25.92 
 
 		 1106 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  26.14 
 
 		 1094 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  26.32 
 
 		 1106 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>