More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1153 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  52.56 
 
 
661 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  55.03 
 
 
636 aa  639    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
657 aa  1350    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  53.72 
 
 
644 aa  634  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  51.35 
 
 
650 aa  624  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  46.74 
 
 
652 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  51.95 
 
 
667 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  51.6 
 
 
639 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  47.83 
 
 
645 aa  544  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  43.82 
 
 
650 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  44.46 
 
 
672 aa  521  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  45.75 
 
 
650 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  41.92 
 
 
650 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  40.66 
 
 
651 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  40.25 
 
 
651 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  44.99 
 
 
638 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  41.19 
 
 
645 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  44.05 
 
 
642 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  43.24 
 
 
663 aa  481  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  41.92 
 
 
643 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  42.35 
 
 
638 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  40.5 
 
 
649 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  39.66 
 
 
646 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  39.83 
 
 
641 aa  435  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  27.46 
 
 
534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  29.86 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  28.99 
 
 
601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  28.85 
 
 
572 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  28.85 
 
 
572 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  28.85 
 
 
553 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  29.44 
 
 
553 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  29.8 
 
 
682 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  28.57 
 
 
606 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  27.75 
 
 
588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.15 
 
 
1088 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  29.39 
 
 
1085 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  28.2 
 
 
548 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  29.21 
 
 
1112 aa  186  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  28.52 
 
 
1115 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  28.76 
 
 
1102 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  28.41 
 
 
591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  27.57 
 
 
1088 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  27.57 
 
 
1088 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  28.44 
 
 
562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  28.94 
 
 
1102 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  28.4 
 
 
556 aa  185  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  28.62 
 
 
1102 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  27.92 
 
 
1100 aa  184  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  28.62 
 
 
577 aa  184  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26.61 
 
 
567 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  28.45 
 
 
1094 aa  183  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  28.89 
 
 
1111 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.63 
 
 
1113 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  28.57 
 
 
1099 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  27.84 
 
 
1092 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  28.21 
 
 
582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  27.05 
 
 
598 aa  180  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  29.1 
 
 
572 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  28.28 
 
 
1100 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  27.86 
 
 
1100 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  28.07 
 
 
1139 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  27.64 
 
 
571 aa  177  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  28.25 
 
 
601 aa  176  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  27.51 
 
 
1121 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  28.52 
 
 
1123 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  27.9 
 
 
1101 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  28.7 
 
 
1105 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  27.05 
 
 
1088 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  29.02 
 
 
596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  29.02 
 
 
596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  29.02 
 
 
596 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  30.75 
 
 
591 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  27.53 
 
 
1088 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  27.4 
 
 
1093 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  27.95 
 
 
1110 aa  174  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  27.44 
 
 
1100 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  27.96 
 
 
1130 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  29.07 
 
 
1113 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  28.5 
 
 
554 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 
553 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  29.78 
 
 
1114 aa  173  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  28.34 
 
 
1106 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  28.34 
 
 
1106 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  28.26 
 
 
604 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.36 
 
 
551 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  28.2 
 
 
1100 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  28.52 
 
 
1106 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  28.2 
 
 
1100 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  29.07 
 
 
1110 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  26.87 
 
 
1093 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  26.48 
 
 
1100 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  27.46 
 
 
1116 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  29.61 
 
 
1099 aa  171  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  27.73 
 
 
1116 aa  170  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  26.94 
 
 
1094 aa  170  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  27.26 
 
 
574 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  28.1 
 
 
556 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  28.04 
 
 
1154 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  26.73 
 
 
1088 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  28 
 
 
598 aa  169  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>