More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3860 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 667 aa  1335    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  56 
 
 		 650 aa  608  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  51.95 
 
 		 657 aa  587  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  46.15 
 
 		 661 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  54.78 
 
 		 636 aa  580  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  50.86 
 
 		 644 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  45.83 
 
 		 652 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  46.08 
 
 		 650 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  46.54 
 
 		 663 aa  527  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  48.21 
 
 		 639 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  47.26 
 
 		 643 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  46.53 
 
 		 672 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  46.15 
 
 		 638 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  50.09 
 
 		 645 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  45.54 
 
 		 642 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  39.02 
 
 		 650 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  39.32 
 
 		 650 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  39.65 
 
 		 651 aa  478  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  38.02 
 
 		 651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  39.27 
 
 		 649 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  38.42 
 
 		 645 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  38.87 
 
 		 646 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  42.11 
 
 		 638 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  38.02 
 
 		 641 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  30.35 
 
 		 553 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  28.2 
 
 		 1085 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  30.48 
 
 		 572 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  27.36 
 
 		 551 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  30.48 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  30.48 
 
 		 572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  25.79 
 
 		 534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  26.6 
 
 		 1100 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  29.17 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  26.74 
 
 		 1088 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  26.74 
 
 		 1088 aa  178  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  26.74 
 
 		 1088 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.11 
 
 		 1152 aa  177  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  29.92 
 
 		 551 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  26.83 
 
 		 1154 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  26.79 
 
 		 1092 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  26.71 
 
 		 1154 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  28.54 
 
 		 1088 aa  174  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  26.91 
 
 		 1093 aa  173  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  26.41 
 
 		 1100 aa  173  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  28.69 
 
 		 1099 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  29.03 
 
 		 1100 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  26.87 
 
 		 1088 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  27.05 
 
 		 1094 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1160 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  28.57 
 
 		 548 aa  171  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  27.82 
 
 		 1108 aa  170  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  28.54 
 
 		 1094 aa  170  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  26.84 
 
 		 1113 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  29.01 
 
 		 1108 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  28.84 
 
 		 1119 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  26.94 
 
 		 1110 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  30.46 
 
 		 558 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.77 
 
 		 1121 aa  169  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  29.38 
 
 		 587 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  27.48 
 
 		 1164 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  28.17 
 
 		 1134 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  26.37 
 
 		 1093 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  27.48 
 
 		 1164 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  27.15 
 
 		 1099 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.08 
 
 		 1104 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  26.97 
 
 		 1100 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  26.24 
 
 		 1100 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  26.91 
 
 		 601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  27.65 
 
 		 1130 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  25.87 
 
 		 1100 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  26.78 
 
 		 1098 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  27.09 
 
 		 591 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  28.18 
 
 		 1101 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  26.29 
 
 		 606 aa  165  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  29.55 
 
 		 1116 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  27.13 
 
 		 1101 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  35.9 
 
 		 567 aa  165  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  26.05 
 
 		 1113 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  25.82 
 
 		 1088 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  29.55 
 
 		 1116 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  26.51 
 
 		 1112 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  26.96 
 
 		 1131 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  26.96 
 
 		 1131 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  26.96 
 
 		 1131 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  26.96 
 
 		 1131 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  26.96 
 
 		 1131 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  26.93 
 
 		 1108 aa  163  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  27.83 
 
 		 585 aa  163  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  29.44 
 
 		 1105 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  26.67 
 
 		 1136 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  28.73 
 
 		 1139 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  26.79 
 
 		 1131 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  25.67 
 
 		 1115 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  26.38 
 
 		 1137 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  27.62 
 
 		 572 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  26.58 
 
 		 556 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  27.02 
 
 		 571 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  24.74 
 
 		 1114 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  26.41 
 
 		 1121 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  26.62 
 
 		 562 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>