More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02416 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  100 
 
 
638 aa  1292    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  44.99 
 
 
657 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  46.93 
 
 
636 aa  501  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  42 
 
 
661 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  41.45 
 
 
644 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  43.13 
 
 
650 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  41.04 
 
 
652 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  42.1 
 
 
650 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  41.74 
 
 
667 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  38.18 
 
 
645 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  37.77 
 
 
649 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  36.85 
 
 
646 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  38.49 
 
 
663 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  46.2 
 
 
639 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  36.14 
 
 
651 aa  412  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  39.77 
 
 
672 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  43.67 
 
 
645 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  39.33 
 
 
638 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  35.36 
 
 
651 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  34.32 
 
 
650 aa  399  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  33.93 
 
 
650 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  38.22 
 
 
643 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  39.06 
 
 
642 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  34.38 
 
 
641 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  32.13 
 
 
601 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  26.93 
 
 
534 aa  196  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  27.89 
 
 
606 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  28.04 
 
 
682 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  29.68 
 
 
1100 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  35.53 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  30.23 
 
 
571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  28.43 
 
 
601 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  29.02 
 
 
1100 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  27.98 
 
 
591 aa  184  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  30.36 
 
 
548 aa  183  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  29.44 
 
 
1099 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  30.23 
 
 
577 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  29.15 
 
 
551 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  28.78 
 
 
1100 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  28.87 
 
 
1105 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.51 
 
 
551 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  29.45 
 
 
596 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  29.45 
 
 
596 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  28.17 
 
 
1106 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  31.41 
 
 
596 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  27.89 
 
 
1100 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  26.19 
 
 
1114 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  29.17 
 
 
572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  29.06 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  28.74 
 
 
567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  30.84 
 
 
587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  29.06 
 
 
572 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  29.88 
 
 
556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  27.82 
 
 
1106 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  32.08 
 
 
604 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  30.43 
 
 
562 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.81 
 
 
1088 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.9 
 
 
1121 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.81 
 
 
1088 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  28.03 
 
 
1115 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  27.82 
 
 
1106 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.57 
 
 
1088 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  30.68 
 
 
610 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  28.5 
 
 
553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  27.55 
 
 
1139 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.39 
 
 
1093 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  28.16 
 
 
1088 aa  173  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  30.36 
 
 
572 aa  173  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  27.6 
 
 
1105 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  28.97 
 
 
1092 aa  173  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  27.61 
 
 
1112 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  27.8 
 
 
1101 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  30.05 
 
 
1123 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  27.39 
 
 
1093 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  28.4 
 
 
1094 aa  171  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  30.5 
 
 
582 aa  170  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  27.87 
 
 
1102 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  29.49 
 
 
1108 aa  170  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  29.43 
 
 
1102 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.42 
 
 
1113 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  27.01 
 
 
1105 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  27.89 
 
 
1108 aa  170  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  27.69 
 
 
1102 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  29.78 
 
 
1100 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  29.4 
 
 
574 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  29.82 
 
 
567 aa  167  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  26.34 
 
 
1094 aa  167  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  29.07 
 
 
1109 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  29 
 
 
1098 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  30.56 
 
 
1130 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  26.7 
 
 
1108 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  27.43 
 
 
1108 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  26.09 
 
 
1100 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  30.15 
 
 
1110 aa  165  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  30.32 
 
 
1110 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  28.01 
 
 
1098 aa  164  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  29.2 
 
 
1101 aa  164  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  27.56 
 
 
1100 aa  164  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  26.24 
 
 
521 aa  163  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  27.64 
 
 
556 aa  163  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>