More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2611 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  64.51 
 
 
651 aa  891    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
650 aa  1357    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  64.56 
 
 
650 aa  901    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  63.94 
 
 
651 aa  903    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  45.38 
 
 
652 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  42.83 
 
 
644 aa  542  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  43.44 
 
 
661 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  43.45 
 
 
650 aa  527  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  43.82 
 
 
657 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  41.31 
 
 
649 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  42.13 
 
 
645 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  43.11 
 
 
663 aa  514  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  44.87 
 
 
636 aa  510  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  46.24 
 
 
650 aa  499  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  41.3 
 
 
646 aa  502  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  40.69 
 
 
638 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  40.51 
 
 
643 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  38.56 
 
 
667 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  40.35 
 
 
642 aa  465  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  41.72 
 
 
672 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  39.76 
 
 
639 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  39.1 
 
 
645 aa  445  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  40 
 
 
641 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  34.32 
 
 
638 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.86 
 
 
551 aa  217  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  27.99 
 
 
553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  27.88 
 
 
534 aa  213  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  27.66 
 
 
548 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  27.54 
 
 
1100 aa  207  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  27.86 
 
 
596 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  27.86 
 
 
596 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  27.86 
 
 
596 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  26.82 
 
 
1100 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  27.26 
 
 
551 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  26.46 
 
 
1093 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  27.03 
 
 
572 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  27.03 
 
 
572 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  26.75 
 
 
1085 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  26.38 
 
 
604 aa  200  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  26.91 
 
 
1108 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  27.32 
 
 
553 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  26.55 
 
 
1100 aa  199  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  26.28 
 
 
1093 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  26.58 
 
 
1100 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  26.49 
 
 
1113 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  28 
 
 
567 aa  197  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  26.12 
 
 
1101 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  27.09 
 
 
1100 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  27.42 
 
 
1108 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  27.17 
 
 
1099 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  27.6 
 
 
1101 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  27.92 
 
 
601 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  26.04 
 
 
571 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  27.8 
 
 
1098 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  27.99 
 
 
1108 aa  195  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  25.17 
 
 
1088 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  25.17 
 
 
1088 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  27.04 
 
 
582 aa  193  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  27.69 
 
 
1100 aa  193  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  25.17 
 
 
1088 aa  193  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  27.62 
 
 
1094 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  27.05 
 
 
1106 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  25.49 
 
 
606 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  27.05 
 
 
1106 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  27.16 
 
 
1100 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  26.32 
 
 
1100 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  27.24 
 
 
1121 aa  191  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  25.96 
 
 
598 aa  191  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  26.75 
 
 
1088 aa  191  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.96 
 
 
1104 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  25.84 
 
 
1092 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  26.42 
 
 
1115 aa  190  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  26.05 
 
 
601 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  27.4 
 
 
1110 aa  190  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  27.5 
 
 
1106 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  26.28 
 
 
1152 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  26.67 
 
 
1094 aa  189  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  26.61 
 
 
1088 aa  189  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  27.27 
 
 
587 aa  188  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  27.24 
 
 
1105 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  25.93 
 
 
1102 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  26.97 
 
 
1102 aa  187  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  26.63 
 
 
1102 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  26.1 
 
 
1088 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  27.29 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  27.3 
 
 
1130 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  26.85 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  25.87 
 
 
577 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  27.24 
 
 
572 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  26.6 
 
 
1164 aa  184  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  27.06 
 
 
556 aa  183  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  26.19 
 
 
591 aa  183  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  26.6 
 
 
1164 aa  184  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  25.83 
 
 
1154 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  26.24 
 
 
585 aa  183  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  26.33 
 
 
588 aa  183  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  26.19 
 
 
1111 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  25.46 
 
 
567 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  26.6 
 
 
1160 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  25.13 
 
 
1154 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>