More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0305 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  53.26 
 
 
641 aa  701    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  49.37 
 
 
650 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  63.44 
 
 
645 aa  845    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  49.53 
 
 
652 aa  658    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  61.76 
 
 
649 aa  811    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
646 aa  1345    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  49.1 
 
 
663 aa  612  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  48.34 
 
 
638 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  47.87 
 
 
643 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  48.08 
 
 
672 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  45.68 
 
 
642 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  40.87 
 
 
651 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  41.3 
 
 
650 aa  502  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  42.93 
 
 
636 aa  499  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  43.12 
 
 
651 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  41.7 
 
 
650 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  40.22 
 
 
644 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  40.75 
 
 
661 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  40.29 
 
 
650 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  39.66 
 
 
657 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  38.7 
 
 
667 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  37.66 
 
 
639 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  37.32 
 
 
638 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  39.62 
 
 
645 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  27.71 
 
 
548 aa  229  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  27.35 
 
 
1088 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  27.65 
 
 
1094 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  27.09 
 
 
1088 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  27.09 
 
 
1088 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  26.75 
 
 
1092 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.62 
 
 
1085 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  26.88 
 
 
1088 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  28.21 
 
 
1100 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  29.69 
 
 
534 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  27.36 
 
 
551 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.19 
 
 
551 aa  211  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  28.76 
 
 
606 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.56 
 
 
1121 aa  209  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  27.3 
 
 
1142 aa  209  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  26.2 
 
 
1088 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.72 
 
 
1093 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  25.91 
 
 
1102 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  26.27 
 
 
1102 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  26.22 
 
 
1102 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  27.68 
 
 
1100 aa  204  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  28.16 
 
 
556 aa  203  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  26.82 
 
 
1109 aa  203  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  26.63 
 
 
1136 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  26.69 
 
 
1139 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  27.54 
 
 
1061 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  27.2 
 
 
1121 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  26.87 
 
 
553 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  26.74 
 
 
553 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  26.74 
 
 
572 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  27.21 
 
 
1093 aa  200  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  26.61 
 
 
1114 aa  200  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  28.29 
 
 
1108 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  26.38 
 
 
572 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  25.93 
 
 
588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  26.82 
 
 
1154 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  26.01 
 
 
1121 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  26.37 
 
 
1099 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  27.06 
 
 
1137 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  26.77 
 
 
1105 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  27.06 
 
 
1137 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  25.09 
 
 
1115 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  28.05 
 
 
682 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  27.06 
 
 
1137 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  26.38 
 
 
1160 aa  198  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  25.3 
 
 
1098 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  25.68 
 
 
1105 aa  198  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  26.85 
 
 
1154 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  26.89 
 
 
601 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  26.28 
 
 
1152 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  25.93 
 
 
556 aa  197  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  26.52 
 
 
1137 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  26.1 
 
 
1101 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  27.75 
 
 
1134 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  24.82 
 
 
1105 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  26.64 
 
 
1106 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26.64 
 
 
567 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  26.72 
 
 
1095 aa  196  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.14 
 
 
1104 aa  195  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 
1138 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  27.38 
 
 
572 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  26.52 
 
 
1137 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  27.34 
 
 
577 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  26.37 
 
 
1098 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  27.03 
 
 
1098 aa  194  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  25.87 
 
 
1100 aa  193  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  26.41 
 
 
1116 aa  193  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  27.02 
 
 
610 aa  193  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  25.42 
 
 
1112 aa  193  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  25.86 
 
 
1164 aa  193  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  25.86 
 
 
1164 aa  193  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  26.48 
 
 
1106 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  26.21 
 
 
1116 aa  193  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  26.24 
 
 
585 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  26.82 
 
 
1131 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  26.82 
 
 
1131 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>